203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2968 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  70.54 
 
 		 829 aa  1193    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  91.72 
 
 		 833 aa  1540    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  76.2 
 
 		 842 aa  1257    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 833 aa  1712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  70.94 
 
 		 831 aa  1202    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  47.94 
 
 		 842 aa  747    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  84.05 
 
 		 837 aa  1437    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  69.06 
 
 		 861 aa  1179    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  41.74 
 
 		 886 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  43.14 
 
 		 859 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  39.63 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  39.63 
 
 		 876 aa  618  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  40.71 
 
 		 862 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  40.49 
 
 		 886 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  40.6 
 
 		 889 aa  581  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  39.08 
 
 		 786 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  39.78 
 
 		 892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  38.3 
 
 		 792 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  38.18 
 
 		 792 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  39.22 
 
 		 777 aa  525  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  37.14 
 
 		 776 aa  502  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  36.38 
 
 		 780 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  37.45 
 
 		 786 aa  492  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  35.06 
 
 		 781 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  33.87 
 
 		 791 aa  462  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  30.8 
 
 		 743 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 746 aa  268  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 816 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  26.54 
 
 		 784 aa  255  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  26.64 
 
 		 748 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 716 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  25.29 
 
 		 886 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  26.43 
 
 		 714 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  26.43 
 
 		 714 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  25.13 
 
 		 756 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 		 724 aa  192  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 		 731 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  31.8 
 
 		 712 aa  170  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  36.24 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.13 
 
 		 799 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.14 
 
 		 801 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  31.99 
 
 		 791 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.46 
 
 		 781 aa  112  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  34.3 
 
 		 783 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  28.72 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.59 
 
 		 799 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.15 
 
 		 784 aa  106  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  26.26 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.32 
 
 		 819 aa  106  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.72 
 
 		 789 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 753 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  29.45 
 
 		 786 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  23.07 
 
 		 751 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  30.66 
 
 		 788 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  31.88 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  28.99 
 
 		 810 aa  101  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  31.88 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  31.88 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  31.88 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  31.88 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  31.88 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  29.08 
 
 		 820 aa  100  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 774 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 799 aa  99.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 786 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  31.44 
 
 		 787 aa  100  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 786 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  29.43 
 
 		 781 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  32.48 
 
 		 761 aa  97.8  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.86 
 
 		 774 aa  97.8  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.33 
 
 		 766 aa  97.4  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  32.73 
 
 		 774 aa  96.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  25.9 
 
 		 766 aa  96.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  29.33 
 
 		 701 aa  95.5  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  31.22 
 
 		 860 aa  95.9  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  29.33 
 
 		 727 aa  95.5  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 		 935 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  22.35 
 
 		 781 aa  94.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.47 
 
 		 924 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 		 938 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.47 
 
 		 771 aa  93.2  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  30.27 
 
 		 937 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  29.19 
 
 		 807 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.24 
 
 		 860 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.91 
 
 		 922 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 824 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  26.48 
 
 		 773 aa  92  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  29.91 
 
 		 808 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 		 856 aa  91.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  32.84 
 
 		 750 aa  91.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  32.84 
 
 		 750 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  32.84 
 
 		 780 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>