198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0652 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  39.86 
 
 
876 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  42.15 
 
 
886 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  39.64 
 
 
862 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  64.71 
 
 
889 aa  1096    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  40.75 
 
 
859 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  39.98 
 
 
876 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  41.13 
 
 
886 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
892 aa  1845    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  40.56 
 
 
833 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  40.35 
 
 
837 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  40.05 
 
 
833 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  39.9 
 
 
842 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  39.5 
 
 
842 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  37.47 
 
 
829 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  39.25 
 
 
831 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  37.36 
 
 
861 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  36.64 
 
 
786 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  36.99 
 
 
792 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  37.16 
 
 
792 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  34.93 
 
 
776 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  34.92 
 
 
780 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  34.21 
 
 
786 aa  436  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  35.64 
 
 
777 aa  422  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  31.42 
 
 
791 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  31.83 
 
 
781 aa  386  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 
743 aa  293  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 
748 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 
767 aa  235  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 
784 aa  227  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 
816 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.97 
 
 
886 aa  204  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 
756 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  25.31 
 
 
746 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 
724 aa  169  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  24.96 
 
 
716 aa  154  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 
712 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  21.43 
 
 
714 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  21.43 
 
 
714 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  28.21 
 
 
731 aa  124  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 
804 aa  117  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  26.03 
 
 
715 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 
810 aa  99.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  29.35 
 
 
791 aa  97.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  31.01 
 
 
799 aa  92.8  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  30.37 
 
 
820 aa  92.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 
813 aa  91.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  30.22 
 
 
783 aa  89.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.57 
 
 
819 aa  89  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  26.06 
 
 
824 aa  88.6  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  26.78 
 
 
788 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  29.26 
 
 
856 aa  86.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.82 
 
 
787 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  26.37 
 
 
789 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 
786 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 
786 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 
786 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 
826 aa  85.1  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  28.29 
 
 
816 aa  85.1  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 
792 aa  85.1  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  25.86 
 
 
786 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.15 
 
 
787 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.15 
 
 
787 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 
787 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 
787 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 
787 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 
787 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 
792 aa  83.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 
813 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 
813 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 
786 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  30.66 
 
 
774 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 
710 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  26.33 
 
 
761 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  28.06 
 
 
811 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.64 
 
 
697 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  24.63 
 
 
787 aa  82  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 
860 aa  81.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 
762 aa  81.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.96 
 
 
751 aa  81.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  23.25 
 
 
841 aa  80.9  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 
776 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 
786 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 
786 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  26.45 
 
 
863 aa  79.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
684 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  25.27 
 
 
799 aa  79  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  23.21 
 
 
839 aa  78.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  23.21 
 
 
839 aa  78.2  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 
938 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 
784 aa  78.2  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  24.52 
 
 
836 aa  77.8  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  25.54 
 
 
788 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 
808 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.4 
 
 
774 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  22.51 
 
 
860 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  24.01 
 
 
701 aa  75.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 
929 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.35 
 
 
832 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  24.01 
 
 
727 aa  75.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
684 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>