204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1759 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  51.19 
 
 
792 aa  800    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  46.57 
 
 
776 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  46.02 
 
 
777 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
786 aa  1611    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  48.03 
 
 
781 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  52.87 
 
 
786 aa  817    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  42.62 
 
 
791 aa  672    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  47.03 
 
 
780 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  51.19 
 
 
792 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  38.66 
 
 
829 aa  511  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  38.53 
 
 
831 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  37.45 
 
 
833 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  37.16 
 
 
861 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  37.11 
 
 
833 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  36.86 
 
 
842 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  37.38 
 
 
876 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  37.56 
 
 
876 aa  486  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  36.63 
 
 
837 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  37.03 
 
 
862 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  36.76 
 
 
859 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  35.54 
 
 
842 aa  475  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  35.69 
 
 
886 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  36.41 
 
 
886 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  34.15 
 
 
892 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  35.78 
 
 
889 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  31.69 
 
 
743 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.33 
 
 
767 aa  262  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  28.15 
 
 
748 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 
784 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.04 
 
 
886 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 
816 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.04 
 
 
746 aa  229  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 
716 aa  219  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.2 
 
 
756 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  26.55 
 
 
715 aa  215  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 
712 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  25.74 
 
 
804 aa  211  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
714 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
714 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.14 
 
 
724 aa  197  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 
731 aa  188  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 
822 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  30.03 
 
 
762 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  29.81 
 
 
701 aa  94.4  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  29.81 
 
 
727 aa  94  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 
937 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  23.28 
 
 
926 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 
801 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.56 
 
 
922 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 
799 aa  89  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  22.39 
 
 
807 aa  88.6  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  23.96 
 
 
781 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 
787 aa  88.6  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  21.9 
 
 
781 aa  88.2  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
863 aa  87.8  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  22.09 
 
 
790 aa  87.8  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  30.34 
 
 
819 aa  87.4  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.29 
 
 
924 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  24.08 
 
 
783 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  24.08 
 
 
791 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  21.74 
 
 
784 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.93 
 
 
799 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  22.81 
 
 
905 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 
781 aa  84  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 
803 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  22.53 
 
 
935 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 
938 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  21.73 
 
 
728 aa  83.2  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  22.21 
 
 
786 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  22.74 
 
 
826 aa  82.4  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  22.21 
 
 
786 aa  82.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
814 aa  82.8  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  22.07 
 
 
786 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  22.07 
 
 
786 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  21.9 
 
 
784 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.66 
 
 
934 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.24 
 
 
932 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  23.32 
 
 
813 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 
794 aa  78.2  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 
786 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 
786 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 
786 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  21.37 
 
 
750 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.01 
 
 
766 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.91 
 
 
788 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  21.81 
 
 
780 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  21.81 
 
 
750 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  28.23 
 
 
786 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  28.23 
 
 
788 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  22.69 
 
 
784 aa  75.1  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.23 
 
 
789 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  21.48 
 
 
735 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  27.11 
 
 
784 aa  74.7  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 
765 aa  74.7  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 
787 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  26.46 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 
765 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  25.25 
 
 
774 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  25.22 
 
 
684 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  22.08 
 
 
799 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>