205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1348 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  46.41 
 
 		 777 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  53.81 
 
 		 778 aa  853    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 781 aa  1600    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  38.8 
 
 		 765 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  38.68 
 
 		 784 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 799 aa  293  8e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  28.93 
 
 		 756 aa  220  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  25.48 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 		 684 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  25.9 
 
 		 628 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  25.34 
 
 		 701 aa  178  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  25.62 
 
 		 684 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  25.24 
 
 		 697 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.63 
 
 		 686 aa  157  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 		 705 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  23.38 
 
 		 813 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.46 
 
 		 765 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  21.49 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  23.28 
 
 		 765 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  23.28 
 
 		 765 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  22.3 
 
 		 773 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 		 765 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  20.48 
 
 		 766 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.99 
 
 		 765 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  23.58 
 
 		 826 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  23.71 
 
 		 935 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  23.41 
 
 		 1091 aa  111  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 		 765 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  22.6 
 
 		 765 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.01 
 
 		 932 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 836 aa  108  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.7 
 
 		 738 aa  107  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 		 765 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 		 753 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 		 765 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.26 
 
 		 751 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 		 781 aa  105  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.85 
 
 		 922 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  21.49 
 
 		 870 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  23.79 
 
 		 832 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  21.59 
 
 		 870 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.15 
 
 		 924 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  21.09 
 
 		 762 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  22.8 
 
 		 926 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 		 671 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.12 
 
 		 905 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.19 
 
 		 774 aa  98.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  22.63 
 
 		 937 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  22.4 
 
 		 929 aa  97.8  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  21.26 
 
 		 774 aa  97.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  23.02 
 
 		 839 aa  97.8  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  22.94 
 
 		 771 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  21.42 
 
 		 766 aa  97.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  22.87 
 
 		 839 aa  96.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 		 786 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 		 786 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 		 743 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.54 
 
 		 938 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  23.73 
 
 		 785 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  22.08 
 
 		 784 aa  95.1  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 		 787 aa  94.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.35 
 
 		 728 aa  94  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  20.75 
 
 		 773 aa  94  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.64 
 
 		 934 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  24.37 
 
 		 792 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 		 792 aa  94  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  22.56 
 
 		 735 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  23.14 
 
 		 794 aa  92.4  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  23.28 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 816 aa  92  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 		 781 aa  90.9  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 		 750 aa  90.9  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 		 750 aa  90.9  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 		 780 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 		 807 aa  90.5  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  26.06 
 
 		 841 aa  90.5  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  21.8 
 
 		 919 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  22.91 
 
 		 810 aa  89  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  22.76 
 
 		 787 aa  88.6  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 		 791 aa  88.6  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  21.6 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 783 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 860 aa  87  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  22.27 
 
 		 811 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  27.33 
 
 		 856 aa  86.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 773 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  28.9 
 
 		 863 aa  84.7  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  21.5 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 		 786 aa  83.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.77 
 
 		 786 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.77 
 
 		 786 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>