203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1679 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 829 aa  1703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  70.17 
 
 		 833 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  67.84 
 
 		 842 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  70.54 
 
 		 833 aa  1184    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  85.01 
 
 		 831 aa  1447    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  72.81 
 
 		 837 aa  1187    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  48.49 
 
 		 842 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  73.3 
 
 		 861 aa  1239    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  41.77 
 
 		 886 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  42.48 
 
 		 886 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  41.01 
 
 		 876 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  41.01 
 
 		 876 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  41.07 
 
 		 862 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  41.17 
 
 		 859 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  39.38 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  39.02 
 
 		 792 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  38.78 
 
 		 786 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  38.66 
 
 		 792 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  38.74 
 
 		 889 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  38.66 
 
 		 786 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  38.15 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  36.62 
 
 		 776 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  36.84 
 
 		 780 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  34.54 
 
 		 791 aa  484  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  36.39 
 
 		 781 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.87 
 
 		 743 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  27.83 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.99 
 
 		 784 aa  252  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 		 746 aa  253  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  26.35 
 
 		 767 aa  249  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.73 
 
 		 748 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.82 
 
 		 886 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25.03 
 
 		 712 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.17 
 
 		 724 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  25.48 
 
 		 714 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  25.48 
 
 		 714 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  29.47 
 
 		 716 aa  213  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 		 756 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.76 
 
 		 804 aa  191  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 731 aa  190  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  25.17 
 
 		 715 aa  189  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.38 
 
 		 801 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 		 799 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  24.6 
 
 		 935 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  31.63 
 
 		 774 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 934 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  23.7 
 
 		 932 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 938 aa  104  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 787 aa  104  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  30.08 
 
 		 937 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  26.69 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.69 
 
 		 926 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  29.41 
 
 		 751 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.28 
 
 		 924 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 		 774 aa  103  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.68 
 
 		 773 aa  103  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.14 
 
 		 922 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  22.5 
 
 		 780 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  22.86 
 
 		 750 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  26.38 
 
 		 905 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 		 787 aa  99.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.17 
 
 		 773 aa  99.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 822 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  33.66 
 
 		 791 aa  99  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  33.66 
 
 		 783 aa  97.8  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  30.14 
 
 		 727 aa  97.4  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  30.14 
 
 		 701 aa  97.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  30.25 
 
 		 786 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  30.25 
 
 		 786 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  33.98 
 
 		 820 aa  95.5  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  30.15 
 
 		 799 aa  94.7  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  29.89 
 
 		 784 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  29.89 
 
 		 786 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  30.62 
 
 		 786 aa  94.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  29.89 
 
 		 786 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 		 784 aa  94  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 738 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  30.48 
 
 		 786 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 766 aa  93.6  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  30.48 
 
 		 786 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  30.48 
 
 		 786 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  29.86 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.43 
 
 		 786 aa  93.2  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  30.81 
 
 		 787 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 		 799 aa  92.8  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  28.89 
 
 		 860 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  29.86 
 
 		 784 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 785 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  30.26 
 
 		 728 aa  92.8  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  92.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  25.42 
 
 		 781 aa  92  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  29.19 
 
 		 788 aa  92  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 		 753 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 807 aa  92  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.62 
 
 		 766 aa  91.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>