202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3473 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  46.6 
 
 		 842 aa  760    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  70.72 
 
 		 829 aa  1203    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  84.41 
 
 		 833 aa  1447    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  73.91 
 
 		 842 aa  1284    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 837 aa  1721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  84.05 
 
 		 833 aa  1446    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  72.17 
 
 		 831 aa  1215    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  70.5 
 
 		 861 aa  1177    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  40.53 
 
 		 886 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  41.79 
 
 		 859 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  40.46 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  40.74 
 
 		 886 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  40.34 
 
 		 876 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  40.88 
 
 		 862 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  40.1 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  39.72 
 
 		 889 aa  582  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  38.65 
 
 		 786 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  38.68 
 
 		 792 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  38.56 
 
 		 792 aa  555  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  38.68 
 
 		 777 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  39.03 
 
 		 776 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  38.84 
 
 		 780 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  36.54 
 
 		 786 aa  485  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  34.85 
 
 		 781 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 791 aa  459  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  31.27 
 
 		 743 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.71 
 
 		 746 aa  279  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.17 
 
 		 767 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 		 816 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.04 
 
 		 784 aa  263  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.14 
 
 		 886 aa  248  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 		 748 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 716 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 724 aa  211  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 		 756 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  25.35 
 
 		 804 aa  203  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25.51 
 
 		 731 aa  191  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  32.34 
 
 		 712 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  34.18 
 
 		 715 aa  143  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.62 
 
 		 784 aa  124  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 		 799 aa  114  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 		 750 aa  108  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 		 780 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  24.01 
 
 		 750 aa  106  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.7 
 
 		 819 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  29.41 
 
 		 774 aa  104  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 		 799 aa  105  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 753 aa  104  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  33.82 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 		 781 aa  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 787 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 		 764 aa  101  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  33.82 
 
 		 783 aa  101  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  30.99 
 
 		 788 aa  101  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  30.66 
 
 		 789 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  31.13 
 
 		 788 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  22.9 
 
 		 860 aa  100  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 751 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  30.13 
 
 		 801 aa  99  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 785 aa  97.8  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  29.83 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  29.83 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  32.38 
 
 		 786 aa  97.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  29.83 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  29.83 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  32.38 
 
 		 786 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  29.83 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  29.83 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  24.28 
 
 		 766 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  30.92 
 
 		 701 aa  95.9  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  30.14 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  30.92 
 
 		 727 aa  95.9  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 		 799 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  26.59 
 
 		 773 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  29.15 
 
 		 787 aa  95.1  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  25.88 
 
 		 774 aa  95.1  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.43 
 
 		 786 aa  95.1  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  30 
 
 		 786 aa  94.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  30 
 
 		 786 aa  94.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  30 
 
 		 786 aa  94.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  27.38 
 
 		 863 aa  92.8  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  23.44 
 
 		 860 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  29.14 
 
 		 820 aa  93.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 		 935 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  36.64 
 
 		 807 aa  92.8  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  28.37 
 
 		 781 aa  91.3  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  27.03 
 
 		 710 aa  90.9  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  28.33 
 
 		 810 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  21.26 
 
 		 762 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  24.52 
 
 		 787 aa  90.5  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.39 
 
 		 824 aa  90.1  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.03 
 
 		 924 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  25.39 
 
 		 773 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  31.65 
 
 		 761 aa  90.1  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  21.92 
 
 		 765 aa  90.1  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 938 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  28.64 
 
 		 929 aa  89  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>