171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0434 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  100 
 
 		 886 aa  1798    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.14 
 
 		 743 aa  354  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 		 767 aa  271  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 748 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 746 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 831 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  26.69 
 
 		 842 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 		 842 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  28.35 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 		 862 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.84 
 
 		 861 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 829 aa  241  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 784 aa  241  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  26.13 
 
 		 837 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 786 aa  234  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 786 aa  233  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 859 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  25.32 
 
 		 833 aa  221  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  28.12 
 
 		 724 aa  219  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  25.19 
 
 		 833 aa  217  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  28.17 
 
 		 886 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  25.06 
 
 		 792 aa  215  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  25.26 
 
 		 792 aa  212  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 781 aa  211  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  27.1 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  25.2 
 
 		 756 aa  207  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 		 892 aa  204  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  26.3 
 
 		 886 aa  204  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  24.87 
 
 		 791 aa  197  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  24.9 
 
 		 776 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 780 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  24.93 
 
 		 716 aa  174  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  23.78 
 
 		 804 aa  169  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 		 816 aa  164  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 		 731 aa  164  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  25.17 
 
 		 715 aa  161  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 712 aa  159  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  30.17 
 
 		 889 aa  150  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 714 aa  145  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 714 aa  145  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  22.97 
 
 		 787 aa  102  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  22.79 
 
 		 728 aa  99  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.27 
 
 		 781 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 762 aa  94  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  23.17 
 
 		 781 aa  89.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 		 863 aa  85.9  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 		 814 aa  85.1  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 		 822 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.24 
 
 		 735 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  22.85 
 
 		 1091 aa  82.4  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26 
 
 		 938 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  24.57 
 
 		 705 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 937 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  26.5 
 
 		 701 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  21.57 
 
 		 929 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  22.52 
 
 		 784 aa  77  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  26.5 
 
 		 727 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.66 
 
 		 932 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  20.3 
 
 		 771 aa  74.7  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.66 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  24.78 
 
 		 934 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  21.38 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  21.88 
 
 		 926 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 		 757 aa  72  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  21.89 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  21.89 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  20.97 
 
 		 786 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  22.45 
 
 		 803 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  20.97 
 
 		 786 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  21.89 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  21.89 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  21.89 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  21.89 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  21.57 
 
 		 791 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  21.2 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.55 
 
 		 774 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  21.25 
 
 		 820 aa  70.1  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  20.97 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  22.94 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  21.64 
 
 		 787 aa  68.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  21.57 
 
 		 783 aa  68.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  20.97 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  27.16 
 
 		 784 aa  67.4  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  24.86 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.93 
 
 		 905 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  25.72 
 
 		 697 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  20.59 
 
 		 764 aa  65.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24.21 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  24.92 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  21.19 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 		 826 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  20.68 
 
 		 773 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  20.99 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>