206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2328 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
762 aa  1585    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  27.52 
 
 
819 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  24.13 
 
 
686 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 
863 aa  187  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  25.88 
 
 
684 aa  185  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  25.18 
 
 
684 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 
710 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  25.47 
 
 
728 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
753 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
773 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.02 
 
 
697 aa  171  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 
774 aa  167  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.34 
 
 
628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  26.48 
 
 
799 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
810 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.85 
 
 
813 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.82 
 
 
811 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.07 
 
 
738 aa  157  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 
764 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 
813 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  24.01 
 
 
774 aa  154  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 
773 aa  154  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  24.2 
 
 
905 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
766 aa  152  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 
774 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 
803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  25.18 
 
 
757 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  32.43 
 
 
786 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  32.09 
 
 
786 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  32.09 
 
 
786 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  32.09 
 
 
786 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  23.9 
 
 
926 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  22.3 
 
 
705 aa  147  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  31.91 
 
 
787 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  31.91 
 
 
787 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 
781 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  31.91 
 
 
787 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  31.91 
 
 
787 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  31.91 
 
 
787 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  31.91 
 
 
787 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  31.91 
 
 
761 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  32.56 
 
 
787 aa  145  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  23.74 
 
 
836 aa  145  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  22.87 
 
 
781 aa  144  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  21.96 
 
 
765 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  30.54 
 
 
789 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  30.23 
 
 
788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.68 
 
 
786 aa  142  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 
786 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 
786 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.8 
 
 
824 aa  140  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  31.99 
 
 
788 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  26.59 
 
 
727 aa  138  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  26.59 
 
 
701 aa  138  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.23 
 
 
799 aa  137  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  24.82 
 
 
1091 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 
787 aa  135  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 
937 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 
799 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  21.53 
 
 
765 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  21.86 
 
 
765 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  21.86 
 
 
765 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  21.48 
 
 
765 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 
781 aa  134  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  21.46 
 
 
924 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  23.52 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  23.52 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 
765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 
765 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  24.91 
 
 
786 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  21.24 
 
 
765 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 
778 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 
784 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  23.47 
 
 
786 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  21.76 
 
 
787 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  22.4 
 
 
801 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  21.8 
 
 
735 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 
780 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.07 
 
 
766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 
750 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  24.73 
 
 
786 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  22.1 
 
 
790 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  24.62 
 
 
807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  24.73 
 
 
786 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  21.82 
 
 
750 aa  128  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 
771 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  23.79 
 
 
751 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.91 
 
 
922 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  21.39 
 
 
765 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  27.48 
 
 
701 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.46 
 
 
932 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 
784 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  22.64 
 
 
813 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 
785 aa  125  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  31.93 
 
 
791 aa  125  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>