223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2474 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  65.41 
 
 
628 aa  878    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 
697 aa  1426    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  53.32 
 
 
710 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  44.98 
 
 
684 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  44.02 
 
 
684 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  42.56 
 
 
705 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  38.86 
 
 
686 aa  502  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  36.62 
 
 
701 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 
799 aa  250  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 
784 aa  220  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  25.14 
 
 
756 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 
765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  24.07 
 
 
777 aa  184  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.49 
 
 
929 aa  180  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 
762 aa  171  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.24 
 
 
781 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  23.99 
 
 
778 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  26.37 
 
 
738 aa  160  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  23.14 
 
 
701 aa  148  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  23.14 
 
 
727 aa  148  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
778 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 
753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
810 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.28 
 
 
728 aa  132  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 
771 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.61 
 
 
757 aa  130  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  30.69 
 
 
781 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  23.14 
 
 
813 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
813 aa  127  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.56 
 
 
938 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.12 
 
 
935 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  29.79 
 
 
781 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  29.81 
 
 
784 aa  124  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 
932 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  21.98 
 
 
811 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.9 
 
 
934 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  24.72 
 
 
836 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  22.28 
 
 
773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.22 
 
 
922 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  23.98 
 
 
671 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 
751 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 
750 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  20.09 
 
 
766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.08 
 
 
821 aa  114  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.81 
 
 
924 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.05 
 
 
819 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  21.14 
 
 
905 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.66 
 
 
926 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  21.49 
 
 
824 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.17 
 
 
919 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
791 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  21.2 
 
 
765 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.98 
 
 
860 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 
765 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 
765 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  21.72 
 
 
765 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  22.94 
 
 
856 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  25.9 
 
 
937 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 
788 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  21.53 
 
 
803 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
783 aa  108  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  20.63 
 
 
774 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  28.06 
 
 
832 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  22.02 
 
 
735 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.81 
 
 
790 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  21.55 
 
 
776 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  23.48 
 
 
1091 aa  105  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  22.55 
 
 
849 aa  105  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  25.83 
 
 
813 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  25.06 
 
 
814 aa  104  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  20.72 
 
 
765 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  28.73 
 
 
997 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.96 
 
 
773 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  21.23 
 
 
765 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 
786 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 
786 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  19.84 
 
 
764 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 
786 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 
786 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 
794 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  21.23 
 
 
765 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 
912 aa  100  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 
799 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  24.46 
 
 
766 aa  100  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 
787 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  23.3 
 
 
808 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  23.92 
 
 
744 aa  100  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  27.81 
 
 
785 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  28.85 
 
 
757 aa  99  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  21.39 
 
 
788 aa  99  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  27.86 
 
 
781 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  24.61 
 
 
826 aa  98.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  22.95 
 
 
774 aa  98.2  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
781 aa  98.2  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 
784 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  20.4 
 
 
765 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  20.4 
 
 
765 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  26.85 
 
 
839 aa  97.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.63 
 
 
774 aa  97.4  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  26.72 
 
 
870 aa  96.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>