225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1159 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
686 aa  1426    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  43.18 
 
 
705 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  39.51 
 
 
710 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  38.13 
 
 
697 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  39.8 
 
 
628 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  36.16 
 
 
684 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  35.77 
 
 
684 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  27.45 
 
 
701 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  24.44 
 
 
799 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
756 aa  217  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 
784 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 
765 aa  193  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  24.13 
 
 
762 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.84 
 
 
777 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.04 
 
 
929 aa  186  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 
781 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  25.4 
 
 
771 aa  161  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  22.77 
 
 
778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.56 
 
 
766 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.54 
 
 
836 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 
778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  23.63 
 
 
790 aa  142  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 
813 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 
813 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 
735 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 
671 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.34 
 
 
766 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  23.12 
 
 
781 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  23.04 
 
 
860 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.82 
 
 
764 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 
784 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.55 
 
 
781 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 
753 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.18 
 
 
773 aa  134  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  25.04 
 
 
738 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  23.56 
 
 
773 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.34 
 
 
774 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 
765 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.41 
 
 
811 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 
849 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  23.45 
 
 
788 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.86 
 
 
728 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  23.29 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  23.29 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  22.89 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
787 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 
761 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  24.08 
 
 
774 aa  125  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 
786 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  23.72 
 
 
750 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
786 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
786 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
786 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  23.4 
 
 
819 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  22.71 
 
 
786 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  22.57 
 
 
776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.17 
 
 
826 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 
757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 
781 aa  119  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  23.76 
 
 
765 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  22.56 
 
 
786 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  23.46 
 
 
765 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.55 
 
 
751 aa  119  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  23 
 
 
810 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  23.32 
 
 
765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 
786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  24.59 
 
 
787 aa  116  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  23.49 
 
 
783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  23.76 
 
 
765 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 
765 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 
765 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.49 
 
 
791 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  23.46 
 
 
765 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  22.65 
 
 
789 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 
937 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 
803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 
774 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 
765 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.44 
 
 
824 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  21.59 
 
 
680 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  23.63 
 
 
788 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  23.65 
 
 
738 aa  109  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 
727 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  22.9 
 
 
701 aa  108  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  24.69 
 
 
839 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  24.84 
 
 
839 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 
938 aa  107  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  22.99 
 
 
677 aa  107  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.95 
 
 
905 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 
813 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  21.97 
 
 
841 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 
799 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  24.57 
 
 
794 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  25.29 
 
 
799 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.43 
 
 
926 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 
787 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  23.24 
 
 
718 aa  103  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>