202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2311 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  67.72 
 
 		 829 aa  1148    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  75.43 
 
 		 837 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  76.08 
 
 		 833 aa  1244    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 842 aa  1725    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  76.2 
 
 		 833 aa  1244    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  71.07 
 
 		 831 aa  1171    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  49.94 
 
 		 842 aa  762    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  67.32 
 
 		 861 aa  1141    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  42.65 
 
 		 886 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  41.44 
 
 		 876 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  40.9 
 
 		 862 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  41.69 
 
 		 876 aa  628  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  42.07 
 
 		 859 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  41.75 
 
 		 886 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  39.88 
 
 		 892 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  39.53 
 
 		 889 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  39.04 
 
 		 786 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  38.9 
 
 		 792 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  38.13 
 
 		 792 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  37.06 
 
 		 776 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  39.04 
 
 		 777 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  37.9 
 
 		 780 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  35.29 
 
 		 791 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  34.69 
 
 		 781 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  36.98 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.33 
 
 		 743 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.05 
 
 		 767 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 		 746 aa  267  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 		 784 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.45 
 
 		 816 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.69 
 
 		 886 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 748 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25.14 
 
 		 712 aa  233  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 		 714 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  27.34 
 
 		 714 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  29.04 
 
 		 716 aa  229  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  26.62 
 
 		 715 aa  214  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.2 
 
 		 724 aa  214  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 		 756 aa  214  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 731 aa  211  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.04 
 
 		 804 aa  204  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.89 
 
 		 764 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 801 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.11 
 
 		 924 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 751 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  28.17 
 
 		 787 aa  107  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.98 
 
 		 922 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  26.12 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  28.76 
 
 		 784 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  24.35 
 
 		 781 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 		 799 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.51 
 
 		 822 aa  105  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.25 
 
 		 932 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  24.67 
 
 		 935 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  30.58 
 
 		 787 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.8 
 
 		 905 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  24.67 
 
 		 934 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.86 
 
 		 753 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 926 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  34.78 
 
 		 791 aa  102  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  27.16 
 
 		 727 aa  102  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  27.16 
 
 		 701 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  25.59 
 
 		 757 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 937 aa  101  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 		 762 aa  101  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  27.5 
 
 		 773 aa  101  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 786 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 786 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  34.78 
 
 		 783 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  29.53 
 
 		 786 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  28.48 
 
 		 738 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 766 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  27.84 
 
 		 784 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 		 938 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  29.53 
 
 		 786 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 		 766 aa  99.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 785 aa  99  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  28.62 
 
 		 810 aa  98.2  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  29.86 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  29.86 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  25.63 
 
 		 773 aa  97.8  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 784 aa  97.8  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 780 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 750 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 765 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 750 aa  95.9  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.07 
 
 		 860 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  26.02 
 
 		 799 aa  95.1  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  26.86 
 
 		 819 aa  95.1  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  31.48 
 
 		 799 aa  94.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  30.15 
 
 		 773 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  25.66 
 
 		 765 aa  94  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 		 765 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 		 765 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>