195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1210 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  48.86 
 
 		 792 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  48.17 
 
 		 786 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  61.32 
 
 		 777 aa  996    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  92.96 
 
 		 780 aa  1503    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  58.21 
 
 		 781 aa  942    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  48.46 
 
 		 786 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  48.32 
 
 		 792 aa  721    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 776 aa  1599    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  41.37 
 
 		 791 aa  615  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  38.15 
 
 		 842 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  39.03 
 
 		 837 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  39.25 
 
 		 833 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  37.89 
 
 		 861 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  37.67 
 
 		 829 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  37.53 
 
 		 831 aa  502  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  38.14 
 
 		 833 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  35.82 
 
 		 842 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  35.63 
 
 		 876 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  35.5 
 
 		 876 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  35.15 
 
 		 862 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  35.03 
 
 		 859 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  36.14 
 
 		 886 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  34.99 
 
 		 886 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  34.93 
 
 		 892 aa  442  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  33.63 
 
 		 889 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  30.91 
 
 		 743 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 		 767 aa  271  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.81 
 
 		 748 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 		 724 aa  240  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 		 784 aa  231  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  24.43 
 
 		 746 aa  220  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  25.7 
 
 		 716 aa  214  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  25.85 
 
 		 804 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 		 816 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 756 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 712 aa  194  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 		 714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 		 714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  25.27 
 
 		 886 aa  181  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  24.71 
 
 		 715 aa  174  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 731 aa  163  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.81 
 
 		 781 aa  97.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  22.71 
 
 		 787 aa  95.5  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.21 
 
 		 784 aa  94.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.37 
 
 		 701 aa  93.6  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 727 aa  93.6  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  23.97 
 
 		 822 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  29.47 
 
 		 801 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  29.47 
 
 		 799 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.07 
 
 		 799 aa  93.2  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.27 
 
 		 819 aa  91.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  22.51 
 
 		 762 aa  88.6  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 		 774 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 		 774 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  28.81 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.05 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  26.82 
 
 		 937 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  23.46 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 		 863 aa  84.7  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  22.27 
 
 		 766 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  34.38 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  23.82 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 684 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  23.95 
 
 		 814 aa  84.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  24.41 
 
 		 765 aa  84  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.09 
 
 		 765 aa  84  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  32.31 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.41 
 
 		 766 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  33.07 
 
 		 780 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  32.31 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 938 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.69 
 
 		 926 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.31 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.68 
 
 		 922 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 		 791 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  28.7 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.78 
 
 		 765 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 785 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  21.58 
 
 		 773 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  28.26 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.27 
 
 		 924 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  28.26 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  26.27 
 
 		 905 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  23.69 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  25.86 
 
 		 784 aa  80.5  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 784 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  24.46 
 
 		 781 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  28.12 
 
 		 753 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 765 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 765 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>