202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1224 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
724 aa  1462    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  32.82 
 
 
816 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  31.09 
 
 
743 aa  313  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 
781 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 
776 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
780 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 
777 aa  227  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.99 
 
 
767 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 
714 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
786 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 
714 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 
829 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  27.75 
 
 
886 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  27.09 
 
 
746 aa  220  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  29.05 
 
 
748 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  24.9 
 
 
842 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.13 
 
 
861 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 
831 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  25.1 
 
 
792 aa  211  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 
837 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  25.07 
 
 
833 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  24.97 
 
 
792 aa  207  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  26.42 
 
 
712 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  25.14 
 
 
786 aa  198  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 
756 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 
791 aa  196  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  24.89 
 
 
716 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 
833 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 
804 aa  190  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  24.47 
 
 
842 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 
731 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  24.76 
 
 
784 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  24.67 
 
 
892 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  24.19 
 
 
715 aa  160  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 
859 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  23 
 
 
889 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 
886 aa  154  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  25.46 
 
 
886 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 
876 aa  149  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 
876 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  23.8 
 
 
862 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  25.31 
 
 
781 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 
822 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  24.37 
 
 
781 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.69 
 
 
790 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.16 
 
 
738 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 
784 aa  105  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  24.82 
 
 
787 aa  104  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  25.31 
 
 
728 aa  103  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 
751 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 
863 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 
820 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  24.63 
 
 
813 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.5 
 
 
684 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 
791 aa  97.4  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  23.34 
 
 
750 aa  97.1  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 
753 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 
932 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.24 
 
 
934 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.88 
 
 
766 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 
783 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  24.59 
 
 
773 aa  94  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.8 
 
 
935 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.62 
 
 
766 aa  93.6  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  27.33 
 
 
781 aa  93.2  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  32.76 
 
 
697 aa  93.2  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 
684 aa  93.2  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  22.51 
 
 
860 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  30.17 
 
 
821 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 
787 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 
799 aa  91.3  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.54 
 
 
938 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  22.83 
 
 
801 aa  90.5  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 
773 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  22.34 
 
 
785 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  29.04 
 
 
765 aa  88.6  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 
849 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  23.36 
 
 
813 aa  87.8  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 
727 aa  87.8  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  23.98 
 
 
774 aa  87.8  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
774 aa  87.8  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  27.42 
 
 
701 aa  87.8  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 
813 aa  87.4  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.8 
 
 
811 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.72 
 
 
799 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  24.36 
 
 
814 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.9 
 
 
922 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 
826 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  30.17 
 
 
774 aa  84.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  22.77 
 
 
856 aa  84.3  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.4 
 
 
764 aa  84  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  26.88 
 
 
757 aa  84  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 
778 aa  84  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  25.24 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.78 
 
 
905 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.26 
 
 
926 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  27.39 
 
 
929 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  25.24 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  25.24 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  25.24 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>