185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1541 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  61.32 
 
 		 776 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 777 aa  1598    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  45.57 
 
 		 792 aa  685    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  46.4 
 
 		 786 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  60.95 
 
 		 780 aa  995    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  46.29 
 
 		 786 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  45.44 
 
 		 792 aa  684    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  58.43 
 
 		 781 aa  906    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  39.35 
 
 		 791 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  39.51 
 
 		 842 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  40.34 
 
 		 861 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  39.83 
 
 		 833 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  39.7 
 
 		 833 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  38.75 
 
 		 837 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  38.9 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  38.52 
 
 		 831 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  36.13 
 
 		 842 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  35.52 
 
 		 859 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  34.32 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  34.61 
 
 		 886 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  36.71 
 
 		 862 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  36.69 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  36.82 
 
 		 876 aa  435  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  35.64 
 
 		 892 aa  422  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  32.95 
 
 		 889 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.05 
 
 		 743 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.22 
 
 		 748 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 767 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  26.18 
 
 		 724 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  25.89 
 
 		 784 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.04 
 
 		 756 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 816 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  27.1 
 
 		 886 aa  210  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 		 712 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  24.87 
 
 		 746 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 		 716 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  23.7 
 
 		 804 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 		 714 aa  194  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 		 714 aa  194  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  24.53 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  23.48 
 
 		 715 aa  171  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  24.06 
 
 		 787 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 		 766 aa  101  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 		 799 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.5 
 
 		 799 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 		 750 aa  100  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.26 
 
 		 684 aa  98.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  23.13 
 
 		 750 aa  97.8  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  23.13 
 
 		 780 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 		 784 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 		 766 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  30.08 
 
 		 819 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 786 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 786 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 786 aa  92  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 786 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  25.28 
 
 		 684 aa  91.3  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  23.42 
 
 		 764 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 		 774 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 791 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  25.45 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.33 
 
 		 771 aa  88.2  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.96 
 
 		 765 aa  88.2  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  29.72 
 
 		 783 aa  87.8  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.86 
 
 		 765 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.14 
 
 		 773 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  26.92 
 
 		 701 aa  87  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 		 727 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  22.43 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 		 765 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.54 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.16 
 
 		 922 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  26 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 784 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  31.94 
 
 		 807 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 		 762 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.28 
 
 		 773 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.32 
 
 		 924 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 765 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  23.53 
 
 		 765 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  22.2 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 		 705 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 778 aa  77.4  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 926 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  25.04 
 
 		 781 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  26.64 
 
 		 937 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 		 765 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  25.68 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.44 
 
 		 765 aa  74.7  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.14 
 
 		 938 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  25.59 
 
 		 799 aa  74.3  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  22.19 
 
 		 738 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 		 860 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.85 
 
 		 934 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  26.39 
 
 		 932 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>