210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1088 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 784 aa  1615    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  45.54 
 
 		 765 aa  693    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  38.03 
 
 		 777 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  38.68 
 
 		 781 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  36.93 
 
 		 778 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  30.67 
 
 		 799 aa  360  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 756 aa  276  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  25.86 
 
 		 710 aa  234  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  26.36 
 
 		 697 aa  220  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  27.66 
 
 		 701 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  26.33 
 
 		 628 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 684 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 686 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 		 705 aa  197  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  25.54 
 
 		 684 aa  188  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.8 
 
 		 922 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  23.25 
 
 		 937 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 		 929 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.08 
 
 		 924 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 		 932 aa  124  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  24.05 
 
 		 860 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  23.07 
 
 		 794 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 		 935 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  23.13 
 
 		 1091 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.8 
 
 		 766 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 		 787 aa  115  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  25.48 
 
 		 753 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 		 926 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 		 773 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 738 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  22.52 
 
 		 757 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  25.22 
 
 		 938 aa  111  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  22.91 
 
 		 774 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 		 762 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 		 774 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  24.03 
 
 		 765 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  21.91 
 
 		 781 aa  110  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  21.81 
 
 		 905 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  23.74 
 
 		 934 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 		 671 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25.59 
 
 		 787 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  22.95 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  22.95 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 766 aa  110  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 765 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.13 
 
 		 728 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 821 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  21.56 
 
 		 781 aa  109  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.41 
 
 		 764 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 751 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  23.97 
 
 		 765 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.38 
 
 		 765 aa  108  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  23.97 
 
 		 765 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 		 765 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  22.26 
 
 		 765 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  24.33 
 
 		 794 aa  104  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  24.74 
 
 		 836 aa  104  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  23.23 
 
 		 727 aa  104  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 		 919 aa  104  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  23.35 
 
 		 701 aa  103  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 		 781 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.57 
 
 		 784 aa  102  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  22.81 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  24.72 
 
 		 792 aa  98.6  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.97 
 
 		 790 aa  98.2  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 		 792 aa  97.8  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 		 786 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 		 786 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 		 786 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.23 
 
 		 822 aa  96.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 		 784 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 		 786 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.17 
 
 		 819 aa  96.3  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  22.86 
 
 		 735 aa  95.1  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 		 799 aa  95.5  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  24.36 
 
 		 773 aa  95.1  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  24.05 
 
 		 826 aa  95.1  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  22.56 
 
 		 771 aa  94.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  22.74 
 
 		 997 aa  94.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  22.58 
 
 		 912 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 		 860 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  23.6 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  23.6 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  23.16 
 
 		 839 aa  91.3  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 		 784 aa  90.9  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 		 801 aa  90.9  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  22.82 
 
 		 785 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  23.04 
 
 		 839 aa  89.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  23.16 
 
 		 781 aa  89  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 		 807 aa  88.6  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  21.5 
 
 		 870 aa  88.2  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  21.5 
 
 		 870 aa  88.2  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 		 856 aa  87.8  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.45 
 
 		 791 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  23.24 
 
 		 710 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  23.27 
 
 		 773 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>