194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0058 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 671 aa  1355    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  27.53 
 
 		 680 aa  208  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 		 686 aa  137  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.82 
 
 		 628 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  25.22 
 
 		 710 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  23.79 
 
 		 697 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22.75 
 
 		 684 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  22.75 
 
 		 756 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 765 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 		 784 aa  110  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  23.57 
 
 		 778 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.78 
 
 		 777 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  24.85 
 
 		 705 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 		 781 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  22.06 
 
 		 799 aa  97.8  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  23.11 
 
 		 701 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  24.28 
 
 		 790 aa  87.4  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  24.55 
 
 		 738 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  26.93 
 
 		 937 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 		 765 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 		 765 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  28.88 
 
 		 744 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 		 765 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 938 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  25.56 
 
 		 781 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  25.89 
 
 		 889 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 		 765 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  25.91 
 
 		 832 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  28.94 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  24.38 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  27.16 
 
 		 718 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  24.41 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 		 781 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  22.55 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  22.55 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  25.7 
 
 		 886 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 		 841 aa  73.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 750 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 		 753 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 780 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  22.97 
 
 		 926 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  26.91 
 
 		 781 aa  71.6  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 765 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 		 765 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 765 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.37 
 
 		 778 aa  70.5  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  19.53 
 
 		 728 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 		 870 aa  70.1  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  22.35 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  22.77 
 
 		 743 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 		 765 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  24.94 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  24.78 
 
 		 826 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  21.99 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.26 
 
 		 774 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  21.51 
 
 		 856 aa  67.8  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  22.32 
 
 		 774 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  25.43 
 
 		 750 aa  67  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 764 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  20.77 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  21.47 
 
 		 922 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.58 
 
 		 801 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.33 
 
 		 751 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.58 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.86 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  22.01 
 
 		 892 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  22.85 
 
 		 905 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  24.51 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  21 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  21.56 
 
 		 924 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 		 791 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  20.83 
 
 		 774 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  32.17 
 
 		 771 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  24.01 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  23.99 
 
 		 786 aa  64.7  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  19.45 
 
 		 773 aa  63.9  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  23.45 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  24.12 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  22.82 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  28.12 
 
 		 766 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24.38 
 
 		 819 aa  62.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  24.12 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  24.12 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  23.1 
 
 		 792 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>