176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0599 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 
710 aa  1466    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  42.28 
 
 
718 aa  536  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  39.32 
 
 
744 aa  525  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  40.22 
 
 
728 aa  519  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  39.83 
 
 
720 aa  512  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  38.69 
 
 
682 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  38.07 
 
 
677 aa  473  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1268  organic solvent tolerance protein, putative  38.22 
 
 
675 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.279939  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0473  putative organic solvent tolerance protein  38.22 
 
 
675 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.242427  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  33.15 
 
 
738 aa  385  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  26.12 
 
 
680 aa  111  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  21.88 
 
 
684 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  21.01 
 
 
684 aa  97.8  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.91 
 
 
628 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  30.1 
 
 
841 aa  96.3  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 
870 aa  95.5  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  22.43 
 
 
750 aa  94.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  27.04 
 
 
870 aa  94.4  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  22.57 
 
 
697 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 
765 aa  94.4  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.55 
 
 
826 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.36 
 
 
710 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  22.04 
 
 
735 aa  91.3  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  26.7 
 
 
788 aa  89  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 
794 aa  87.8  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  22.11 
 
 
686 aa  87.4  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  23.24 
 
 
784 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  25.79 
 
 
786 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  23.15 
 
 
799 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  37.19 
 
 
778 aa  85.1  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  25.79 
 
 
788 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 
786 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 
787 aa  84  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 
801 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  26.98 
 
 
813 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  26.16 
 
 
771 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  26.13 
 
 
784 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 
926 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 
789 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  23.47 
 
 
756 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  31.76 
 
 
790 aa  83.2  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.6 
 
 
799 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 
786 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 
786 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 
786 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.38 
 
 
937 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  27.32 
 
 
799 aa  81.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 
786 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  26.3 
 
 
905 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
912 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  24.78 
 
 
1131 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  24.78 
 
 
808 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 
791 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 
783 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  26.2 
 
 
786 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
764 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 
705 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  27.18 
 
 
816 aa  78.2  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.62 
 
 
932 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.73 
 
 
824 aa  77.8  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.51 
 
 
922 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
997 aa  77.4  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
934 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
938 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 
935 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  23.92 
 
 
787 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
807 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 
671 aa  75.1  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.46 
 
 
929 aa  74.3  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  24.17 
 
 
810 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 
794 aa  73.9  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  32.46 
 
 
792 aa  73.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  32.46 
 
 
792 aa  73.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.48 
 
 
832 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  23.57 
 
 
753 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.69 
 
 
924 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
776 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
761 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  24.45 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  24.45 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  24.45 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 
757 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 
773 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  23.42 
 
 
787 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  23.96 
 
 
781 aa  69.7  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  20.18 
 
 
774 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  33.64 
 
 
836 aa  68.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.71 
 
 
701 aa  68.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  24.54 
 
 
813 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 
814 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
727 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  24.12 
 
 
765 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  26.34 
 
 
750 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  26.34 
 
 
750 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.87 
 
 
765 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.87 
 
 
765 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  26.34 
 
 
780 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>