191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0437 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 
680 aa  1372    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 
671 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  21.5 
 
 
686 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  26.39 
 
 
710 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.59 
 
 
705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 
710 aa  104  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  24.94 
 
 
720 aa  101  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  25.44 
 
 
738 aa  100  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  22.72 
 
 
684 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  24.04 
 
 
682 aa  97.8  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22.36 
 
 
684 aa  97.4  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  27.23 
 
 
718 aa  96.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  29.13 
 
 
728 aa  95.9  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0473  putative organic solvent tolerance protein  24.39 
 
 
675 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.242427  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1268  organic solvent tolerance protein, putative  24.54 
 
 
675 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.279939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  21.65 
 
 
799 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  24.69 
 
 
628 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  25.18 
 
 
697 aa  90.9  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  30.13 
 
 
799 aa  90.9  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  22.72 
 
 
791 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 
820 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  29.09 
 
 
744 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  22.72 
 
 
783 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  22.47 
 
 
765 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  24.88 
 
 
701 aa  84  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.18 
 
 
816 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 
727 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 
774 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  21.32 
 
 
716 aa  81.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  21.21 
 
 
777 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  24.43 
 
 
822 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  21.02 
 
 
701 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  20.79 
 
 
856 aa  78.2  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  23.53 
 
 
677 aa  77  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 
937 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  21.88 
 
 
814 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  24.22 
 
 
832 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  23.83 
 
 
756 aa  73.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 
808 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
870 aa  72.8  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 
790 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  26.15 
 
 
776 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
870 aa  71.6  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.49 
 
 
922 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  24.43 
 
 
833 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 
778 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  23.79 
 
 
786 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  22.47 
 
 
788 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 
789 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  24.28 
 
 
743 aa  69.7  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
833 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  24.55 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 
938 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.09 
 
 
926 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.72 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
829 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 
837 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  24.17 
 
 
860 aa  68.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 
842 aa  67.8  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  22.91 
 
 
786 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  23.98 
 
 
842 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  19 
 
 
781 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  20.89 
 
 
784 aa  67  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  21.78 
 
 
728 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  26.22 
 
 
735 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  19.79 
 
 
715 aa  65.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 
889 aa  64.7  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  25.79 
 
 
861 aa  65.1  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  25.45 
 
 
831 aa  64.7  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  22.59 
 
 
753 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  21.46 
 
 
886 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  24.17 
 
 
860 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  41.77 
 
 
826 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  24.57 
 
 
746 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.75 
 
 
924 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  25.78 
 
 
774 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  25.32 
 
 
765 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  25.74 
 
 
765 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  22.37 
 
 
784 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  21.53 
 
 
731 aa  60.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 
765 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 
765 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  21.07 
 
 
765 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  22.98 
 
 
804 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  22.63 
 
 
841 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 
863 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  24.54 
 
 
778 aa  60.1  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  21.86 
 
 
816 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  25.74 
 
 
765 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  25.32 
 
 
765 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  23.27 
 
 
934 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  21.82 
 
 
766 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 
781 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  20.45 
 
 
886 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24 
 
 
819 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  40.58 
 
 
781 aa  58.9  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>