193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1389 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 
682 aa  1391    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1268  organic solvent tolerance protein, putative  98.67 
 
 
675 aa  1363    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.279939  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  60.61 
 
 
677 aa  827    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0473  putative organic solvent tolerance protein  98.52 
 
 
675 aa  1362    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.242427  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  42.31 
 
 
720 aa  558  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  42.55 
 
 
718 aa  554  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  41.11 
 
 
728 aa  548  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  40 
 
 
744 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  38.69 
 
 
710 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  31.69 
 
 
738 aa  364  3e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 
684 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 
684 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  24.38 
 
 
680 aa  94  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  27.67 
 
 
750 aa  92  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 
686 aa  90.5  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  22.58 
 
 
765 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  29.24 
 
 
870 aa  88.6  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  28.99 
 
 
870 aa  88.6  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  31.13 
 
 
790 aa  87.4  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 
751 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 
787 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  20.99 
 
 
628 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 
771 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  21.52 
 
 
735 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.5 
 
 
938 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  22.46 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  23.71 
 
 
767 aa  80.5  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 
912 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 
997 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 
813 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
926 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 
799 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  29.3 
 
 
794 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.87 
 
 
905 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 
932 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.71 
 
 
710 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 
935 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  38.89 
 
 
778 aa  77.8  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.89 
 
 
753 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 
934 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.37 
 
 
774 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.74 
 
 
705 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 
781 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
937 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  29.59 
 
 
791 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  22.3 
 
 
756 aa  74.7  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  29.05 
 
 
1131 aa  74.3  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.98 
 
 
860 aa  74.3  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.63 
 
 
765 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  24.44 
 
 
781 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 
799 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 
826 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.57 
 
 
924 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  29.59 
 
 
783 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.68 
 
 
922 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 
836 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 
781 aa  72.8  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  25.96 
 
 
801 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 
792 aa  71.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  24.41 
 
 
773 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.01 
 
 
774 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  29.37 
 
 
792 aa  70.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 
788 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 
784 aa  70.5  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  23.99 
 
 
784 aa  69.7  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 
807 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  32.81 
 
 
788 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  21.78 
 
 
765 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  33.59 
 
 
789 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 
738 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  29.77 
 
 
787 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.21 
 
 
773 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  21.66 
 
 
765 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 
764 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  21.66 
 
 
765 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 
799 aa  67.4  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  29.8 
 
 
786 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  23.93 
 
 
776 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  21.78 
 
 
765 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  26.15 
 
 
929 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  24.44 
 
 
786 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  25.43 
 
 
750 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  20.1 
 
 
766 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  31.97 
 
 
821 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  25.43 
 
 
780 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  21.2 
 
 
765 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  25.43 
 
 
750 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  26.7 
 
 
816 aa  66.6  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  26.89 
 
 
765 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  20.74 
 
 
765 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  20.74 
 
 
765 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  21.81 
 
 
766 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 
786 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 
816 aa  64.7  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  22.17 
 
 
829 aa  64.7  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  26.87 
 
 
778 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.22 
 
 
701 aa  64.3  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>