191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0506 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  60.61 
 
 		 682 aa  808    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 677 aa  1381    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0473  putative organic solvent tolerance protein  59.97 
 
 		 675 aa  796    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.242427  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1268  organic solvent tolerance protein, putative  60.41 
 
 		 675 aa  802    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.279939  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  41.89 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  39.78 
 
 		 728 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  40.59 
 
 		 718 aa  523  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  39.35 
 
 		 744 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  38.07 
 
 		 710 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  29.78 
 
 		 738 aa  335  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 686 aa  101  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  28.77 
 
 		 750 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  29.82 
 
 		 778 aa  87  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  27.31 
 
 		 799 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  27.31 
 
 		 735 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  22.53 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 		 813 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 		 781 aa  81.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  22.43 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  21.64 
 
 		 684 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  24.06 
 
 		 771 aa  78.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  27.4 
 
 		 774 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  21.98 
 
 		 684 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 		 774 aa  77  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  28.28 
 
 		 912 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 		 791 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  28.48 
 
 		 788 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  29.28 
 
 		 997 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.36 
 
 		 826 aa  76.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.56 
 
 		 870 aa  76.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  28.21 
 
 		 822 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  23.89 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 870 aa  75.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.69 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  29.2 
 
 		 1131 aa  73.9  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  27.85 
 
 		 788 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 		 773 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  27.85 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.59 
 
 		 781 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 		 766 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 		 938 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 765 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  20.38 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  26.24 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 		 799 aa  71.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 932 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  22.94 
 
 		 765 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  22.54 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  23.51 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.41 
 
 		 765 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  22.51 
 
 		 765 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  22.51 
 
 		 765 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  24.34 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.13 
 
 		 860 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  22.78 
 
 		 751 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 790 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  23.44 
 
 		 794 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 765 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  20.5 
 
 		 935 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  23.3 
 
 		 773 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  38 
 
 		 671 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  32.2 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.02 
 
 		 922 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 		 801 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.39 
 
 		 710 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 765 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  20 
 
 		 937 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 765 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  27.97 
 
 		 765 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  21.67 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  23.9 
 
 		 799 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  26.02 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  28.4 
 
 		 839 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  21.91 
 
 		 926 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  21.86 
 
 		 924 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  28.93 
 
 		 712 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  21.35 
 
 		 905 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  26.23 
 
 		 787 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.24 
 
 		 929 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  23.44 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 		 836 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  24.3 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  28.97 
 
 		 856 aa  64.7  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  22.26 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  24.3 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 816 aa  64.3  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 757 aa  63.9  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.16 
 
 		 839 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>