179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0426 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0426  organic solvent tolerance protein, putative  100 
 
 
738 aa  1523    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.695489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  33.15 
 
 
710 aa  385  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1336  protein CysQ  31.78 
 
 
728 aa  378  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0490  elongation factor P (EF-P)  31.51 
 
 
720 aa  365  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1389  organic solvent tolerance protein, putative  31.69 
 
 
682 aa  356  1e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0473  putative organic solvent tolerance protein  32.01 
 
 
675 aa  356  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.242427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1259  putative periplasmic protein  32.61 
 
 
718 aa  351  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1268  organic solvent tolerance protein, putative  31.71 
 
 
675 aa  350  7e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.279939  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0506  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  29.78 
 
 
677 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  29.03 
 
 
744 aa  334  4e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 
686 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  27.3 
 
 
628 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  25.44 
 
 
680 aa  96.3  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  21.95 
 
 
684 aa  91.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  23.55 
 
 
794 aa  90.1  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.24 
 
 
697 aa  87.8  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  22.05 
 
 
684 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  27.59 
 
 
870 aa  87.4  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 
870 aa  87  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 
938 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 
671 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.59 
 
 
788 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.6 
 
 
922 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 
937 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  20.83 
 
 
735 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 
765 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.29 
 
 
926 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
765 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
765 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
765 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  23.55 
 
 
826 aa  77.4  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.74 
 
 
781 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 
764 aa  77  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  25.91 
 
 
934 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  25.51 
 
 
905 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  19.64 
 
 
756 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  24.47 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  22.63 
 
 
710 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  23.24 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 
789 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  22.3 
 
 
794 aa  74.3  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 
788 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  22.9 
 
 
781 aa  73.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.27 
 
 
924 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  23.5 
 
 
765 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  23.96 
 
 
765 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  23.96 
 
 
765 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.7 
 
 
932 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  24.38 
 
 
935 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
771 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  21.97 
 
 
836 aa  70.1  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  23.5 
 
 
765 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  29.1 
 
 
1131 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 
813 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.1 
 
 
773 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 
765 aa  68.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  30.09 
 
 
839 aa  68.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  26.83 
 
 
701 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.45 
 
 
766 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 
824 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  27.78 
 
 
790 aa  67  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.38 
 
 
773 aa  67.4  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.15 
 
 
765 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
714 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
714 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  28.95 
 
 
787 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.17 
 
 
839 aa  65.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  24.18 
 
 
919 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
786 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 
813 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
786 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
786 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  24.19 
 
 
810 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  23.41 
 
 
821 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
786 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  23.46 
 
 
786 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
786 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  22.82 
 
 
799 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  24.76 
 
 
792 aa  63.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 
727 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  24.26 
 
 
701 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 
912 aa  62.8  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 
849 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 
997 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.54 
 
 
792 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 
813 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.64 
 
 
757 aa  61.6  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  21.82 
 
 
766 aa  61.6  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  24 
 
 
841 aa  61.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
712 aa  61.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  21.97 
 
 
784 aa  61.2  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.8 
 
 
811 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  26.27 
 
 
833 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.74 
 
 
822 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.23 
 
 
774 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  22.18 
 
 
786 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 
829 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  25.46 
 
 
862 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  25.52 
 
 
859 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>