199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1119 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  83.61 
 
 		 714 aa  1165    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  83.61 
 
 		 714 aa  1165    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 712 aa  1424    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  44.57 
 
 		 716 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  43.69 
 
 		 804 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  44.13 
 
 		 731 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  41.85 
 
 		 715 aa  528  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  28.09 
 
 		 743 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  25.73 
 
 		 842 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  28 
 
 		 831 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 842 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 		 837 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  25.83 
 
 		 816 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  25.75 
 
 		 861 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  25.78 
 
 		 833 aa  230  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 		 833 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  25.17 
 
 		 829 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  26.14 
 
 		 786 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  25.83 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 746 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  25.85 
 
 		 777 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 		 780 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  24.32 
 
 		 792 aa  201  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  24.79 
 
 		 776 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  24.72 
 
 		 862 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 781 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  23.84 
 
 		 792 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 		 876 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 		 767 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 		 876 aa  194  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 		 886 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  24.83 
 
 		 859 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  25.23 
 
 		 886 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 		 748 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  23.3 
 
 		 784 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.12 
 
 		 886 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 756 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  22.9 
 
 		 892 aa  154  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  29.33 
 
 		 889 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  26.12 
 
 		 791 aa  115  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  23.15 
 
 		 799 aa  98.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  22.21 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  26.26 
 
 		 701 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  20.94 
 
 		 790 aa  95.9  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  26.26 
 
 		 727 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 		 764 aa  94.4  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.74 
 
 		 799 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  23.28 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  20.53 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  26.65 
 
 		 863 aa  84  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  20.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  20.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  20.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  22 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  20.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  20.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  20.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  20.43 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  20.67 
 
 		 784 aa  82  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  21.63 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  21.98 
 
 		 780 aa  81.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 774 aa  81.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  20.52 
 
 		 785 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  21.63 
 
 		 750 aa  80.5  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  21.76 
 
 		 735 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  26.57 
 
 		 822 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  24.41 
 
 		 771 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  19.89 
 
 		 784 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  20.52 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  19.97 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  19.97 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  19.97 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  19.97 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 814 aa  78.2  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  28.85 
 
 		 762 aa  77.8  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  21.58 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  21.58 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 791 aa  77.4  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 799 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  21.52 
 
 		 766 aa  77  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  28.41 
 
 		 821 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  26.23 
 
 		 813 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  25.75 
 
 		 765 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  25.17 
 
 		 781 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  25.89 
 
 		 738 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  29.26 
 
 		 787 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  26.01 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  21.21 
 
 		 766 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.02 
 
 		 824 aa  75.1  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  24.82 
 
 		 705 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  25.17 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  21.47 
 
 		 765 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.74 
 
 		 765 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  26.41 
 
 		 781 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  22.34 
 
 		 774 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  25.96 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24.86 
 
 		 819 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>