199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1188 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 716 aa  1431    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  45.16 
 
 		 714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  45.16 
 
 		 714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  44.57 
 
 		 712 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  43.39 
 
 		 731 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  42.66 
 
 		 804 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  43.87 
 
 		 715 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  29.2 
 
 		 743 aa  270  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 		 842 aa  240  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  27.35 
 
 		 861 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 786 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  27.38 
 
 		 781 aa  234  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  29.04 
 
 		 842 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  26.42 
 
 		 792 aa  225  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  25.93 
 
 		 833 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  29.62 
 
 		 831 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  28.46 
 
 		 833 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  26.17 
 
 		 792 aa  220  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  27.25 
 
 		 786 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 		 780 aa  217  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  25.63 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 		 791 aa  213  9e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  29.47 
 
 		 829 aa  213  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  27.09 
 
 		 837 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  28.05 
 
 		 746 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  28.17 
 
 		 886 aa  207  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  25.23 
 
 		 767 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 862 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 876 aa  205  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  25.65 
 
 		 777 aa  203  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  27.26 
 
 		 816 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 		 886 aa  200  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  27.71 
 
 		 876 aa  193  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.21 
 
 		 724 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  24.97 
 
 		 748 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  25.92 
 
 		 784 aa  181  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  24.9 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 756 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  33.12 
 
 		 859 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  24.96 
 
 		 892 aa  154  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 889 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  25.61 
 
 		 819 aa  114  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  25.25 
 
 		 814 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 863 aa  102  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.13 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.93 
 
 		 799 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.51 
 
 		 790 aa  98.6  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 		 791 aa  98.2  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  23.52 
 
 		 783 aa  97.8  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  22.67 
 
 		 778 aa  97.4  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  21.19 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  22.86 
 
 		 822 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  21.19 
 
 		 701 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  24.12 
 
 		 735 aa  94  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  23.65 
 
 		 810 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  21.83 
 
 		 860 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  27.89 
 
 		 705 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 753 aa  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  22.69 
 
 		 774 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  20.83 
 
 		 771 aa  87.4  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  21.68 
 
 		 781 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  21.15 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  22.64 
 
 		 787 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 		 751 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.41 
 
 		 766 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 		 824 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  22.18 
 
 		 787 aa  81.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  23.12 
 
 		 849 aa  80.9  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 		 813 aa  80.9  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  24.12 
 
 		 738 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  23.82 
 
 		 820 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  27.57 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  27.33 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.49 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  24.08 
 
 		 786 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.26 
 
 		 811 aa  77.4  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 813 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 		 789 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 		 856 aa  76.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 		 761 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  21.14 
 
 		 787 aa  77  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  24.69 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  24.69 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  24.12 
 
 		 776 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  27.81 
 
 		 684 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  23.51 
 
 		 788 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  21.79 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>