196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0685 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  48.86 
 
 
776 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  100 
 
 
792 aa  1636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  45.57 
 
 
777 aa  685    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  85.86 
 
 
786 aa  1424    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  52.59 
 
 
786 aa  794    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  46.81 
 
 
781 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  48.23 
 
 
791 aa  793    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  48.53 
 
 
780 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  98.99 
 
 
792 aa  1622    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  39.74 
 
 
833 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  39.9 
 
 
842 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  39.84 
 
 
837 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  38.92 
 
 
829 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  40.13 
 
 
861 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  39.87 
 
 
833 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  39.48 
 
 
831 aa  545  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  37.12 
 
 
842 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  36.76 
 
 
862 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  38.26 
 
 
859 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  37.44 
 
 
876 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  37.44 
 
 
876 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  36.83 
 
 
886 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  35.64 
 
 
886 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  36.99 
 
 
892 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  35.46 
 
 
889 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.87 
 
 
743 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 
767 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27 
 
 
784 aa  262  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.2 
 
 
748 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 
816 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  27.58 
 
 
804 aa  224  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 
756 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 
716 aa  218  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  25.06 
 
 
886 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.13 
 
 
724 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  23.87 
 
 
746 aa  209  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 
714 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 
714 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  24.1 
 
 
715 aa  171  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  24.17 
 
 
731 aa  169  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  26.82 
 
 
712 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.54 
 
 
922 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
684 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  23.1 
 
 
937 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  23.84 
 
 
924 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  30.26 
 
 
934 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 
757 aa  87.8  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
932 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.85 
 
 
938 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 
710 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
935 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 
684 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  24.5 
 
 
781 aa  85.9  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  26.44 
 
 
781 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  24.42 
 
 
905 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
787 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  21.11 
 
 
813 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 
801 aa  82  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.56 
 
 
799 aa  81.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  24.53 
 
 
799 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.37 
 
 
926 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  23.76 
 
 
863 aa  80.5  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  25.09 
 
 
791 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  28.28 
 
 
819 aa  77.8  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  23.47 
 
 
792 aa  77.8  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  26.88 
 
 
799 aa  77.8  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 
783 aa  77.4  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 
787 aa  77.8  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  23.32 
 
 
774 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  24.44 
 
 
919 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  27.36 
 
 
701 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  25.52 
 
 
860 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  23.76 
 
 
781 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 
727 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  24.8 
 
 
807 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.38 
 
 
705 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.4 
 
 
765 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  23.1 
 
 
792 aa  75.5  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 
786 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.47 
 
 
766 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  27.2 
 
 
816 aa  74.7  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 
784 aa  74.7  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  30.12 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  30.12 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 
786 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 
786 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.9 
 
 
784 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 
786 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  25.73 
 
 
762 aa  73.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  30.89 
 
 
761 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  28.1 
 
 
811 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  25.97 
 
 
778 aa  72.8  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.21 
 
 
824 aa  72.8  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  21.25 
 
 
774 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 
836 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>