200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3941 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 
876 aa  1785    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  95.71 
 
 
862 aa  1700    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  99.66 
 
 
876 aa  1781    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  69.94 
 
 
886 aa  1220    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  70.88 
 
 
886 aa  1219    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  76.25 
 
 
859 aa  1370    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  39.88 
 
 
892 aa  641    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  41.69 
 
 
842 aa  629  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  40.42 
 
 
833 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  39.14 
 
 
889 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  40.59 
 
 
837 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  40.61 
 
 
842 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  40.8 
 
 
833 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  41.19 
 
 
829 aa  596  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  40.77 
 
 
831 aa  598  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  39.35 
 
 
861 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  37.44 
 
 
792 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  36.42 
 
 
786 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  37.21 
 
 
792 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  37.53 
 
 
786 aa  482  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  34.88 
 
 
780 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  35.63 
 
 
776 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  37.21 
 
 
781 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  36.82 
 
 
777 aa  435  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  33.2 
 
 
791 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  31.38 
 
 
743 aa  363  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.53 
 
 
784 aa  263  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 
767 aa  260  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  28.66 
 
 
748 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  28.35 
 
 
886 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 
816 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.39 
 
 
756 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 
714 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 
714 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 
716 aa  191  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.23 
 
 
804 aa  187  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  26.85 
 
 
715 aa  184  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  30.27 
 
 
746 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  27.02 
 
 
731 aa  177  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  24.51 
 
 
724 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
712 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28 
 
 
813 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 
792 aa  105  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  29.12 
 
 
792 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  32.27 
 
 
762 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 
791 aa  101  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 
826 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.03 
 
 
799 aa  99.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 
783 aa  98.2  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  33.05 
 
 
938 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
814 aa  97.8  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  23.22 
 
 
822 aa  97.8  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  26.87 
 
 
774 aa  97.4  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 
766 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  26.55 
 
 
774 aa  96.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  29.93 
 
 
788 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  30.7 
 
 
786 aa  95.9  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 
764 aa  95.5  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 
773 aa  95.1  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  30.8 
 
 
937 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  30.36 
 
 
935 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  23.21 
 
 
860 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  30.33 
 
 
786 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  26.83 
 
 
765 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  29.77 
 
 
786 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  30.36 
 
 
932 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  29.77 
 
 
786 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  29.77 
 
 
786 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 
788 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.63 
 
 
919 aa  92.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  29.74 
 
 
753 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.32 
 
 
701 aa  92.4  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 
934 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 
727 aa  92  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.96 
 
 
926 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  30.23 
 
 
786 aa  92  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  30.23 
 
 
786 aa  92  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  26.05 
 
 
905 aa  91.3  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  29.38 
 
 
765 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  31.02 
 
 
773 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.95 
 
 
922 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  29.38 
 
 
765 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 
789 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.14 
 
 
924 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  29.38 
 
 
765 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  25.82 
 
 
808 aa  88.6  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 
757 aa  88.6  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  30.74 
 
 
820 aa  88.6  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.59 
 
 
765 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  28.67 
 
 
787 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.53 
 
 
766 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  23.47 
 
 
856 aa  87  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.91 
 
 
765 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  29.76 
 
 
787 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  29.76 
 
 
787 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 
863 aa  86.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 
787 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 
787 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 
787 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 
787 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>