49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0147 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  100 
 
 
708 aa  1409    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  24.27 
 
 
908 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 
1061 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  28.22 
 
 
1111 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 
1061 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 
705 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  25.17 
 
 
697 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  28.08 
 
 
882 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  25.88 
 
 
907 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  27.4 
 
 
906 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0607  OstA family protein  25.19 
 
 
1194 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00470061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  23.98 
 
 
743 aa  61.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  25.14 
 
 
862 aa  60.8  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.72 
 
 
1040 aa  60.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  23.44 
 
 
701 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17430  Organic solvent tolerance protein OstA  25.45 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  27.96 
 
 
1210 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  28.46 
 
 
880 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  21.05 
 
 
781 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  24.69 
 
 
771 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  21.72 
 
 
756 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.58 
 
 
777 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  19.78 
 
 
684 aa  55.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 
765 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  23.65 
 
 
842 aa  54.3  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  24.23 
 
 
972 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  21.61 
 
 
784 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  20.6 
 
 
833 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  24.65 
 
 
701 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  19.61 
 
 
684 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  24.74 
 
 
899 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  22.37 
 
 
710 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 
727 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  20.59 
 
 
861 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  21.15 
 
 
833 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  22.48 
 
 
735 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0161  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  21.14 
 
 
667 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  21.01 
 
 
836 aa  48.5  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  20.26 
 
 
837 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  20.93 
 
 
753 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  24.37 
 
 
853 aa  47.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  22.42 
 
 
750 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  24.36 
 
 
906 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  22.27 
 
 
789 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.37 
 
 
811 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  20.39 
 
 
826 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  19.02 
 
 
842 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  25.53 
 
 
951 aa  44.3  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  22.76 
 
 
786 aa  43.9  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>