33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4903 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  100 
 
 
1210 aa  2467    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  47.56 
 
 
972 aa  904    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  31.91 
 
 
899 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  30.48 
 
 
882 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  29.59 
 
 
926 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  30.04 
 
 
951 aa  364  5.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.71 
 
 
922 aa  331  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  27.78 
 
 
889 aa  317  9e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  27.64 
 
 
1049 aa  314  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  29.34 
 
 
870 aa  307  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  26.27 
 
 
906 aa  277  7e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  25.72 
 
 
907 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  24.02 
 
 
908 aa  221  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  24.16 
 
 
906 aa  211  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  23.68 
 
 
882 aa  210  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  22.56 
 
 
880 aa  153  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  29.09 
 
 
862 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  24.4 
 
 
853 aa  106  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  21.84 
 
 
628 aa  58.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  23.01 
 
 
701 aa  55.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.94 
 
 
777 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  21.47 
 
 
684 aa  53.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  23.58 
 
 
784 aa  51.6  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  25.17 
 
 
727 aa  51.6  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.17 
 
 
701 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  23.26 
 
 
697 aa  50.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 
781 aa  50.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
705 aa  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  22.81 
 
 
832 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22.67 
 
 
684 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  27.96 
 
 
708 aa  46.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 
778 aa  45.8  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  22.18 
 
 
778 aa  45.8  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>