31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1870 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  100 
 
 
882 aa  1806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  36.01 
 
 
926 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  34.6 
 
 
951 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  33.69 
 
 
1049 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  33.94 
 
 
906 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  31.96 
 
 
899 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  32.9 
 
 
972 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  31.68 
 
 
922 aa  406  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  30.48 
 
 
1210 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  31.74 
 
 
870 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.25 
 
 
889 aa  343  1e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  24.8 
 
 
882 aa  220  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  23.7 
 
 
907 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  24.11 
 
 
908 aa  212  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  22.04 
 
 
906 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  23.99 
 
 
880 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  24.03 
 
 
862 aa  91.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  25.91 
 
 
853 aa  89.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  24.86 
 
 
705 aa  51.2  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  21.24 
 
 
938 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  26.29 
 
 
684 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 
710 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  28.86 
 
 
628 aa  48.5  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  24.73 
 
 
765 aa  48.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 
684 aa  47.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  22.22 
 
 
777 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 
892 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.33 
 
 
784 aa  45.8  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 
1131 aa  44.7  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  26.85 
 
 
744 aa  44.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
791 aa  44.3  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>