49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1691 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  100 
 
 		 870 aa  1748    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  30.54 
 
 		 926 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  31.87 
 
 		 882 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  31.66 
 
 		 951 aa  335  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.05 
 
 		 922 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  29.49 
 
 		 899 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  29.37 
 
 		 1210 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  28.69 
 
 		 906 aa  318  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1049 aa  303  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  28.8 
 
 		 972 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  26.95 
 
 		 889 aa  279  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  27.73 
 
 		 907 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  27.61 
 
 		 906 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  26.42 
 
 		 908 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  26.14 
 
 		 882 aa  232  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  25.49 
 
 		 862 aa  191  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  25.2 
 
 		 880 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  22.53 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.72 
 
 		 697 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.48 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  20.49 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.36 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 		 784 aa  57.4  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 		 773 aa  57.4  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  24.14 
 
 		 684 aa  55.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23 
 
 		 765 aa  54.7  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  21.7 
 
 		 765 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  21.7 
 
 		 765 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  21.74 
 
 		 774 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  27.01 
 
 		 701 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 		 684 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.05 
 
 		 735 aa  52  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  20.19 
 
 		 766 aa  52  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  19.71 
 
 		 766 aa  51.6  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  23.49 
 
 		 860 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 929 aa  50.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  21.57 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  20.37 
 
 		 750 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 686 aa  49.3  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 791 aa  48.9  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 		 808 aa  48.5  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  24.68 
 
 		 783 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0437  Organic solvent tolerance protein  25.56 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  27.46 
 
 		 776 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 		 863 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  23.55 
 
 		 820 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  23.73 
 
 		 773 aa  45.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>