43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11093 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  100 
 
 
1049 aa  2129    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  48.17 
 
 
906 aa  815    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  52.19 
 
 
922 aa  904    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  34 
 
 
882 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  30.87 
 
 
951 aa  422  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  32.22 
 
 
926 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  31.21 
 
 
899 aa  373  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.11 
 
 
889 aa  348  2e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  30.8 
 
 
972 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.77 
 
 
1210 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.27 
 
 
870 aa  296  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  26.38 
 
 
907 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  28.52 
 
 
906 aa  278  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  26.08 
 
 
908 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  24.52 
 
 
882 aa  221  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  23.91 
 
 
862 aa  157  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  22.03 
 
 
853 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  25 
 
 
880 aa  95.5  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  26.73 
 
 
701 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  25.6 
 
 
628 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0607  OstA family protein  26.32 
 
 
1194 aa  57  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00470061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 
836 aa  52  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.9 
 
 
710 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  27.03 
 
 
684 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  26.28 
 
 
684 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.91 
 
 
938 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  29.48 
 
 
810 aa  49.3  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  21.74 
 
 
705 aa  49.3  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.81 
 
 
697 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.72 
 
 
832 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  25.9 
 
 
774 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  31.58 
 
 
813 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.94 
 
 
924 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  24.8 
 
 
765 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 
1040 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  25 
 
 
750 aa  45.8  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  25.6 
 
 
727 aa  45.8  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  25.6 
 
 
701 aa  45.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.55 
 
 
922 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  22.63 
 
 
937 aa  45.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.89 
 
 
905 aa  45.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  20.71 
 
 
686 aa  45.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 
934 aa  44.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>