40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0749 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  100 
 
 
899 aa  1848    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  34.04 
 
 
972 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  32.42 
 
 
1210 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  31.96 
 
 
882 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  30.79 
 
 
926 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  29.23 
 
 
951 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  29.5 
 
 
889 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  30.13 
 
 
906 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  31.21 
 
 
1049 aa  360  5e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  30.1 
 
 
922 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  29.35 
 
 
870 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  25.87 
 
 
907 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  26.22 
 
 
908 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  24.86 
 
 
882 aa  249  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  24.69 
 
 
906 aa  222  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  24.4 
 
 
862 aa  194  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  24.24 
 
 
880 aa  188  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  22.04 
 
 
853 aa  156  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  21.71 
 
 
628 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  22.65 
 
 
686 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  21.64 
 
 
697 aa  61.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  24.59 
 
 
832 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  24.43 
 
 
701 aa  55.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0607  OstA family protein  22.87 
 
 
1194 aa  53.5  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00470061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.49 
 
 
784 aa  51.6  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.89 
 
 
765 aa  50.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
1040 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  24.03 
 
 
1091 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 
705 aa  49.3  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 
836 aa  48.5  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  19.13 
 
 
774 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  22 
 
 
684 aa  47  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  19.13 
 
 
684 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  23.12 
 
 
813 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  23.6 
 
 
701 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 
856 aa  45.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  23.6 
 
 
727 aa  45.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  29.46 
 
 
860 aa  45.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  24.89 
 
 
784 aa  44.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 
826 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>