121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1942 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  42.4 
 
 
880 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  100 
 
 
908 aa  1872    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  56.01 
 
 
882 aa  1047    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  45.45 
 
 
907 aa  796    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  48.95 
 
 
906 aa  808    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  44.77 
 
 
862 aa  782    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  36.85 
 
 
853 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  26.22 
 
 
899 aa  264  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.42 
 
 
922 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  25.79 
 
 
1049 aa  239  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  26.14 
 
 
870 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  24.97 
 
 
906 aa  233  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  24.23 
 
 
951 aa  222  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.12 
 
 
1210 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  24.11 
 
 
882 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  23.7 
 
 
926 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  30.11 
 
 
972 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.09 
 
 
889 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 
684 aa  88.2  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  27.07 
 
 
684 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  22.29 
 
 
686 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.93 
 
 
697 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  26.55 
 
 
832 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.27 
 
 
710 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  24.17 
 
 
701 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  25.22 
 
 
628 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  22.31 
 
 
705 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  21.52 
 
 
924 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  25.82 
 
 
708 aa  62  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 
791 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  22.84 
 
 
1091 aa  59.3  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  23.26 
 
 
788 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  28.29 
 
 
777 aa  58.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 
784 aa  57.4  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  23.92 
 
 
905 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  23.31 
 
 
773 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 
1040 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  21.56 
 
 
935 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  23.8 
 
 
926 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  27.65 
 
 
792 aa  55.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  25.48 
 
 
786 aa  55.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  23.27 
 
 
841 aa  55.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  27.65 
 
 
792 aa  54.7  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0607  OstA family protein  21.46 
 
 
1194 aa  54.3  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00470061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  20.89 
 
 
922 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  23.89 
 
 
932 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  21.61 
 
 
764 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  25.31 
 
 
786 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 
780 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17430  Organic solvent tolerance protein OstA  25 
 
 
566 aa  53.9  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  23.32 
 
 
937 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 
788 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.58 
 
 
762 aa  52.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  24.32 
 
 
783 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.85 
 
 
765 aa  53.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 
789 aa  52  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
774 aa  52  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  20.77 
 
 
784 aa  52  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  22.75 
 
 
934 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 
787 aa  52  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  19.67 
 
 
799 aa  51.6  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  24.21 
 
 
776 aa  51.6  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  23.38 
 
 
787 aa  51.2  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
765 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 
786 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 
766 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 
786 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 
786 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  19.51 
 
 
781 aa  50.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  22.53 
 
 
938 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  26.24 
 
 
807 aa  50.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 
801 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  22.27 
 
 
774 aa  49.7  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0161  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  22.12 
 
 
667 aa  49.3  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.79 
 
 
811 aa  48.9  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  21.76 
 
 
773 aa  49.3  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 
813 aa  48.9  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 
799 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.21 
 
 
839 aa  48.9  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.16 
 
 
766 aa  48.9  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 
813 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  20.06 
 
 
781 aa  48.5  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  26.42 
 
 
774 aa  48.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  26.53 
 
 
839 aa  48.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 
753 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  23.89 
 
 
786 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 
765 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  22.07 
 
 
870 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  23.89 
 
 
786 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.31 
 
 
821 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  22.66 
 
 
997 aa  47  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 
765 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 
765 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.75 
 
 
765 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.11 
 
 
790 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 
765 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 
765 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  22.07 
 
 
870 aa  47  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  23.33 
 
 
765 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 
771 aa  46.2  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>