41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1405 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  100 
 
 
951 aa  1966    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  34.6 
 
 
882 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  33.37 
 
 
926 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  30.87 
 
 
1049 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  31.21 
 
 
972 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  30.76 
 
 
906 aa  406  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  30.29 
 
 
922 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  29.23 
 
 
899 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  31.15 
 
 
1210 aa  364  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.54 
 
 
889 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  31.38 
 
 
870 aa  324  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  24.89 
 
 
907 aa  233  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  23.63 
 
 
882 aa  220  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  23.68 
 
 
908 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  24.18 
 
 
906 aa  204  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  23.22 
 
 
880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  27.13 
 
 
862 aa  112  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  22.87 
 
 
853 aa  89.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.67 
 
 
628 aa  65.1  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  24.37 
 
 
697 aa  54.7  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.2 
 
 
922 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  25.27 
 
 
860 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  22.09 
 
 
905 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 
786 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 
786 aa  49.3  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  25.9 
 
 
926 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 
786 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 
786 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  31.21 
 
 
786 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 
836 aa  48.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  26.99 
 
 
814 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  21.67 
 
 
686 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  25.3 
 
 
937 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
935 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  24.42 
 
 
932 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.78 
 
 
924 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.52 
 
 
710 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 
929 aa  45.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  29.94 
 
 
786 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  29.94 
 
 
786 aa  44.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  23.04 
 
 
934 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>