44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1560 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  48.28 
 
 		 1049 aa  805    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1857    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  53.45 
 
 		 922 aa  905    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  34.32 
 
 		 926 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  34.67 
 
 		 882 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  30.76 
 
 		 951 aa  416  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  30.04 
 
 		 899 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.89 
 
 		 889 aa  349  1e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  30.58 
 
 		 972 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  28.54 
 
 		 870 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  27.51 
 
 		 907 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  26.08 
 
 		 1210 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  25.17 
 
 		 908 aa  231  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  24.94 
 
 		 906 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  23.48 
 
 		 882 aa  221  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  21.39 
 
 		 862 aa  127  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  21.53 
 
 		 853 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  25.44 
 
 		 880 aa  94.4  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  21.61 
 
 		 628 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  20.85 
 
 		 697 aa  57.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  27.81 
 
 		 777 aa  57.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  24 
 
 		 701 aa  55.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  24.7 
 
 		 684 aa  52  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 		 684 aa  51.2  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 765 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 		 705 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  23.83 
 
 		 832 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  24.58 
 
 		 774 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  21.4 
 
 		 766 aa  48.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 		 765 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  24.1 
 
 		 765 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  23.49 
 
 		 765 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  24.18 
 
 		 766 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.49 
 
 		 765 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  20.52 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  26.21 
 
 		 744 aa  45.8  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  21.31 
 
 		 938 aa  45.8  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 839 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.17 
 
 		 839 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  29.66 
 
 		 937 aa  45.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  25.33 
 
 		 778 aa  44.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  24.16 
 
 		 776 aa  44.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>