57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1298 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  100 
 
 		 853 aa  1756    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  40.47 
 
 		 862 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  36.74 
 
 		 908 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  36.99 
 
 		 882 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  37.16 
 
 		 880 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  33.07 
 
 		 907 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  33.59 
 
 		 906 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  22.04 
 
 		 899 aa  157  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  22.2 
 
 		 870 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  21.53 
 
 		 906 aa  121  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1049 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  21.13 
 
 		 926 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.4 
 
 		 1210 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  25.94 
 
 		 972 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  18.76 
 
 		 889 aa  92.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  25.91 
 
 		 882 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  23.04 
 
 		 951 aa  90.1  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  21.87 
 
 		 922 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  20.83 
 
 		 686 aa  64.3  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  28.85 
 
 		 697 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  24.64 
 
 		 701 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  28.87 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  25.26 
 
 		 839 aa  58.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  27.88 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 		 762 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 		 774 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  24.74 
 
 		 839 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  22.44 
 
 		 753 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0161  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  24.73 
 
 		 667 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  27.59 
 
 		 771 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  24.48 
 
 		 710 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17430  Organic solvent tolerance protein OstA  21.79 
 
 		 566 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  23.36 
 
 		 766 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 		 813 aa  48.9  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  22.18 
 
 		 860 aa  47.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.74 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  22.39 
 
 		 773 aa  47.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.24 
 
 		 728 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.42 
 
 		 811 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  21.61 
 
 		 774 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  21.07 
 
 		 905 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  23.19 
 
 		 764 aa  47  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  21.07 
 
 		 926 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 		 813 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  26.89 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  19.1 
 
 		 781 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  21.9 
 
 		 937 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.11 
 
 		 773 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 		 1131 aa  45.8  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  21.59 
 
 		 799 aa  45.8  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  22.07 
 
 		 774 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  21.95 
 
 		 832 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 		 766 aa  45.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  19.48 
 
 		 781 aa  44.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.71 
 
 		 821 aa  44.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  23.3 
 
 		 826 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>