71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6190 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6190  putative organic solvent tolerance protein OstA  100 
 
 		 926 aa  1912    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1870  Organic solvent tolerance protein OstA  36.01 
 
 		 882 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1405  hypothetical protein  33.37 
 
 		 951 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1560  hypothetical protein  34.32 
 
 		 906 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1049 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  30.79 
 
 		 899 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4586  organic solvent tolerance protein OstA-like protein  30.63 
 
 		 922 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4903  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  29.59 
 
 		 1210 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1645  hypothetical protein  28.28 
 
 		 889 aa  365  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1691  Organic solvent tolerance protein OstA-like protein  30.53 
 
 		 870 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3634  hypothetical protein  30.17 
 
 		 972 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0777  hypothetical protein  24.14 
 
 		 907 aa  225  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  23.82 
 
 		 906 aa  207  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  23.59 
 
 		 908 aa  204  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0492  hypothetical protein  22.07 
 
 		 882 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0536  hypothetical protein  23.24 
 
 		 880 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0828  hypothetical protein  22 
 
 		 862 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1298  hypothetical protein  21.1 
 
 		 853 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.445914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  24.88 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  23.88 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  23.62 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  22.79 
 
 		 832 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  24.15 
 
 		 905 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  23.93 
 
 		 786 aa  55.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 932 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  24.15 
 
 		 926 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  25.4 
 
 		 935 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  25 
 
 		 792 aa  52.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  22.03 
 
 		 697 aa  52.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  26.11 
 
 		 934 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  25 
 
 		 792 aa  52  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  25.95 
 
 		 833 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  22.93 
 
 		 686 aa  51.6  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 929 aa  51.2  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  23.68 
 
 		 628 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.62 
 
 		 836 aa  50.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  20.69 
 
 		 705 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.54 
 
 		 922 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.54 
 
 		 924 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  22.62 
 
 		 710 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  24.46 
 
 		 808 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  26.67 
 
 		 791 aa  49.3  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 		 849 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 938 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  25.34 
 
 		 766 aa  48.5  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 813 aa  48.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  24.32 
 
 		 701 aa  48.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  23.68 
 
 		 751 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  32.23 
 
 		 811 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 813 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  27.05 
 
 		 791 aa  47.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  25.19 
 
 		 833 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  23.61 
 
 		 774 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  26.57 
 
 		 783 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 750 aa  46.2  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  24.66 
 
 		 860 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  25.32 
 
 		 892 aa  45.8  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 1111 aa  45.8  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  32.99 
 
 		 813 aa  45.8  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  25.86 
 
 		 837 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  21.28 
 
 		 814 aa  45.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  25.15 
 
 		 728 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  22.26 
 
 		 822 aa  45.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.03 
 
 		 826 aa  45.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.14 
 
 		 919 aa  45.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  24.44 
 
 		 786 aa  45.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1054  organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 		 757 aa  45.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0233273  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 		 774 aa  44.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  26.17 
 
 		 829 aa  44.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 714 aa  44.3  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  23.2 
 
 		 714 aa  44.3  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>