29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0607 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0607  OstA family protein  100 
 
 
1194 aa  2427    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00470061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  23.83 
 
 
705 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  24.57 
 
 
778 aa  65.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  25 
 
 
777 aa  65.1  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  20.56 
 
 
686 aa  64.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.11 
 
 
781 aa  59.3  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17430  Organic solvent tolerance protein OstA  21.27 
 
 
566 aa  58.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11093  hypothetical protein  26.32 
 
 
1049 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0147  OstA family protein  25.51 
 
 
708 aa  56.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  21.34 
 
 
701 aa  55.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1942  hypothetical protein  21.46 
 
 
908 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.328684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0749  hypothetical protein  22.87 
 
 
899 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0833179  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0674  hypothetical protein  22.12 
 
 
906 aa  52.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.62108  hitchhiker  0.00476533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  21.7 
 
 
701 aa  52.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  21.7 
 
 
727 aa  52.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 
1061 aa  49.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 
1061 aa  49.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 
1040 aa  48.9  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  23.35 
 
 
756 aa  48.9  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3845  organic solvent tolerance protein  23.43 
 
 
697 aa  48.5  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73195  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  21.24 
 
 
784 aa  48.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  21.62 
 
 
784 aa  48.5  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  22.12 
 
 
937 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  22.46 
 
 
816 aa  47  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  23.18 
 
 
710 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  20.59 
 
 
905 aa  46.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  20.23 
 
 
932 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  20.23 
 
 
935 aa  46.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  22.12 
 
 
765 aa  45.8  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>