164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0190 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 		 337 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  32.34 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  32.59 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  32.28 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  32.28 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  30.48 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  30.48 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  33.01 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  29.93 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.61 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  29.61 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  29.28 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  29.28 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  29.28 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  29.28 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  31.95 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.06 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  32.83 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  30.42 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  33.01 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  29.53 
 
 		 324 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  29.93 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.92 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  35.46 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.41 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  32.52 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.93 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  32 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  29.65 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  31.69 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  31.08 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  30.61 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.59 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.23 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  31.55 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.78 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  30.15 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.43 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  31.78 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  32.11 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  32.06 
 
 		 366 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  31.98 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  31.69 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  30.23 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  29.63 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.77 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.71 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.86 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  28.03 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  25.08 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  25.08 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.53 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.4 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.09 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  27.59 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  25.99 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.43 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  25 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  26.9 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.71 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.62 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  24 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.34 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1357  O-succinylbenzoic acid synthetase, putative  27.33 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  27.46 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  29.25 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.27 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.54 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.6 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.49 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  23 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  25.38 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.77 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  21.05 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.41 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.97 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  27.97 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  21.74 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.11 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  21.89 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  24.18 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  22.99 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.34 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  31.06 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  31.06 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  22.39 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.59 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  25 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.58 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.78 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.57 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  21.7 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  21.03 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  24.86 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>