208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2806 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
363 aa  713    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  34.85 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.93 
 
 
309 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  32.94 
 
 
315 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  33.64 
 
 
314 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  33.64 
 
 
305 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  31.14 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  30.84 
 
 
322 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  34.29 
 
 
322 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  33.73 
 
 
316 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  26.67 
 
 
322 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  31.15 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.03 
 
 
323 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  26.03 
 
 
323 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  23.31 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  24.13 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  24.37 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.22 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.53 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.58 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  24.37 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.84 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.68 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  23.42 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  30.98 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.97 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.01 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  24.54 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.77 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.07 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.04 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  25.65 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.44 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  28.39 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.8 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.16 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  28.25 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  27.76 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  33.79 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.3 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  27.94 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  28.25 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.55 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  28.04 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  27.1 
 
 
327 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  27.74 
 
 
322 aa  63.2  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.7 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.3 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.65 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.76 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.47 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.78 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.3 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.62 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  25.26 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  26.1 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.26 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.99 
 
 
350 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
353 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.99 
 
 
350 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.9 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  30.3 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.48 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.68 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  30.12 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.68 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.91 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.87 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  21.52 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.52 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  25.74 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.52 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.5 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  25.64 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.09 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.85 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3571  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.16 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314823  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.52 
 
 
373 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.17 
 
 
345 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.3 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  27.5 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  27.5 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  27.5 
 
 
320 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  27.91 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  27.5 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  27.5 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  27.5 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.28 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.01 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.14 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  27.5 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.05 
 
 
347 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.49 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.47 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  29.32 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
955 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  27.66 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>