More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1718 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 
363 aa  735    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.57 
 
 
357 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.35 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  49.86 
 
 
357 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  50 
 
 
357 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.15 
 
 
365 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.89 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.23 
 
 
359 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  32.54 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  32.84 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  29.43 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  29.71 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.49 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.43 
 
 
325 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  30.4 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  31.86 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  31 
 
 
367 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  29.23 
 
 
349 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.73 
 
 
388 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  30.77 
 
 
351 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  29.54 
 
 
324 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  30.77 
 
 
364 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  29.61 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  29.31 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  28.14 
 
 
323 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  31.58 
 
 
366 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  28.44 
 
 
323 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  32.28 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  31.93 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  31.93 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  29.84 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  29.67 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  27.2 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.4 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.38 
 
 
333 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  23.65 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  28.8 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.8 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  28.8 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  28.8 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.51 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.58 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  29.05 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  29.05 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  30.65 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.21 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  29.05 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  30.33 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  28.16 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  29.05 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  28.16 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.59 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.73 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  26.23 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  27.67 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  31.25 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.12 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.68 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.14 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.77 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.6 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.69 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.6 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.82 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.77 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.68 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  28.1 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.14 
 
 
335 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.25 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.2 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  28.74 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.86 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.08 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.21 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.19 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.05 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  28.72 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  24.05 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.86 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  23.46 
 
 
322 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.14 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 
955 aa  66.2  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  25.51 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  23.46 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.65 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.86 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.86 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.12 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.9 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>