More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5705 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  93.72 
 
 
366 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
366 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.59 
 
 
368 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.12 
 
 
368 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.48 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.38 
 
 
371 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  64.4 
 
 
370 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.7 
 
 
380 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.67 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  60.11 
 
 
369 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.27 
 
 
369 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.53 
 
 
370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  47.83 
 
 
369 aa  333  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.38 
 
 
370 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.15 
 
 
375 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.88 
 
 
371 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  44.29 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  46.31 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.99 
 
 
368 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.09 
 
 
370 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.82 
 
 
370 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.87 
 
 
370 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  42.9 
 
 
368 aa  292  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  47.09 
 
 
370 aa  292  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.13 
 
 
370 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  42.9 
 
 
368 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  42.9 
 
 
368 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  42.62 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  42.62 
 
 
368 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  42.62 
 
 
368 aa  288  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  42.9 
 
 
368 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  42.35 
 
 
368 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  42.35 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.08 
 
 
377 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.08 
 
 
368 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.01 
 
 
372 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.53 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.38 
 
 
377 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.23 
 
 
378 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  32.02 
 
 
370 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  37.07 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.82 
 
 
391 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.05 
 
 
377 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  31.39 
 
 
366 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
955 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  30.98 
 
 
1027 aa  145  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.8 
 
 
385 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.82 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.25 
 
 
355 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.64 
 
 
369 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.64 
 
 
369 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.68 
 
 
386 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  30.79 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  30.79 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  30.25 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.19 
 
 
367 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.53 
 
 
367 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.49 
 
 
385 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  34.55 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.08 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 
367 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.49 
 
 
367 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  34.27 
 
 
391 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.49 
 
 
373 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.51 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.99 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.48 
 
 
365 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.73 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.66 
 
 
369 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
346 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.41 
 
 
375 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.66 
 
 
369 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.93 
 
 
369 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.51 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.17 
 
 
372 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  29.23 
 
 
377 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  26.95 
 
 
370 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.49 
 
 
386 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.46 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.17 
 
 
396 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.46 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28 
 
 
409 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  29.23 
 
 
373 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 
356 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.2 
 
 
369 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.46 
 
 
369 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  28.97 
 
 
370 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  35.89 
 
 
334 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.5 
 
 
400 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.39 
 
 
393 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.09 
 
 
377 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.09 
 
 
377 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.92 
 
 
377 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28.89 
 
 
394 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 
378 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.23 
 
 
373 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.25 
 
 
391 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28.73 
 
 
400 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>