More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1716 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 375 aa  773    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  73.78 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.59 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  54.2 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  53.93 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  54.2 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  55.28 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  53.93 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  54.75 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  53.93 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  53.93 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  53.66 
 
 		 368 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.93 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.3 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.96 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.67 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.05 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.05 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  50 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  50.58 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.79 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.51 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  50.57 
 
 		 370 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.79 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  46.61 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.36 
 
 		 371 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.55 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  49.15 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.73 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.98 
 
 		 369 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.2 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.44 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  47.73 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  46.96 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.72 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.44 
 
 		 377 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.37 
 
 		 370 aa  285  8e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  44.86 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.64 
 
 		 378 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  32.78 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  36.31 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 955 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.8 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.99 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.01 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.29 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  27.75 
 
 		 1027 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  31.56 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.59 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  33.92 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.5 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.77 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.77 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.49 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.43 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.77 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  28.61 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.61 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.74 
 
 		 378 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.82 
 
 		 366 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.4 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.71 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  28.1 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.34 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.83 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  27.92 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  25.81 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4061  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.95 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.59 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  28.1 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.07 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.67 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  25.94 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  27.96 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.07 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  26.67 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.87 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.07 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.4 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  27.82 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.4 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.12 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.67 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.76 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.35 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  27.94 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.39 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  26.67 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.96 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.54 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>