More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3662 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  87.27 
 
 		 377 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  87 
 
 		 377 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  95.49 
 
 		 377 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  87.27 
 
 		 377 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  96.02 
 
 		 377 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  89.39 
 
 		 377 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  87 
 
 		 377 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  100 
 
 		 377 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  94.96 
 
 		 377 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  92.31 
 
 		 377 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  87.27 
 
 		 377 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  99.2 
 
 		 377 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  87 
 
 		 377 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  94.96 
 
 		 377 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  87 
 
 		 377 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  79.58 
 
 		 385 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  78.78 
 
 		 385 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  74.8 
 
 		 385 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  70.57 
 
 		 369 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  70.84 
 
 		 369 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.23 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  61.46 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  61.58 
 
 		 377 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  61.46 
 
 		 373 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  62.63 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  60.92 
 
 		 373 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  61.19 
 
 		 373 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  62.26 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  62.87 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  66.3 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  62.87 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.29 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  64.42 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  59.24 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  62.26 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  58.86 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  60 
 
 		 374 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  60.16 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  59.3 
 
 		 374 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  64.23 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  58.42 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  57.18 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  51.76 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  48.37 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  49.73 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  49.2 
 
 		 400 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  47.97 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  49.3 
 
 		 409 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  43.6 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.63 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  42.78 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  47.71 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  38.38 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.98 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.98 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.98 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.6 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.81 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.68 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.52 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.89 
 
 		 393 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  31.92 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.14 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  30.45 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.53 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.35 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  32.08 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  30.18 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  29.61 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.64 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.06 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.5 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.78 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.78 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.14 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.73 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.5 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.11 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.78 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.78 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.5 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.5 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.78 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.65 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.85 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.29 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.82 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.53 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.68 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.39 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.07 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.46 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.67 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.44 
 
 		 350 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>