More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6587 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  93.92 
 
 		 378 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  98.94 
 
 		 378 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  100 
 
 		 387 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  90.74 
 
 		 378 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  74.39 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  71.98 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  64.86 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  58.93 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  64.77 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  65.04 
 
 		 377 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  64.77 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  64.77 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  65.04 
 
 		 377 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  65.04 
 
 		 377 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  64.77 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  64.5 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  64.66 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  63.49 
 
 		 369 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  62.87 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.95 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  62.87 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.14 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  63.69 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  63.22 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  63.04 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  58.87 
 
 		 373 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  58.81 
 
 		 374 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  58.97 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  63.59 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  63.59 
 
 		 377 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.14 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  63.59 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  60.75 
 
 		 385 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  57.88 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  58.06 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.95 
 
 		 385 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  57.84 
 
 		 375 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  56.18 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  60.75 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  56.45 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  52.42 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  56.72 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  49.32 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  48.26 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  48.03 
 
 		 400 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.74 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.21 
 
 		 409 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  43.67 
 
 		 370 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  45.31 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  41.19 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  41.07 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  43.24 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  43.32 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.43 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.27 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.13 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.88 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.59 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.73 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.73 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.73 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.18 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.46 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.92 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.92 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.72 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.92 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.35 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.73 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 		 367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  30.29 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.49 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.6 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.83 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  26.75 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.88 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  27.35 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  27.57 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.27 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.79 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.05 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.81 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.79 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.26 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  28.34 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.08 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.79 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.08 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.79 
 
 		 350 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.49 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.35 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0645  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.15 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.151939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>