More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1408 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  100 
 
 
371 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.37 
 
 
375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  35.69 
 
 
369 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  35.69 
 
 
369 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.71 
 
 
346 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  35.94 
 
 
391 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.28 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.17 
 
 
378 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.75 
 
 
396 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.09 
 
 
386 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  33.33 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.84 
 
 
373 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.72 
 
 
356 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.01 
 
 
390 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.26 
 
 
373 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.06 
 
 
395 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32 
 
 
385 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.83 
 
 
372 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.96 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.84 
 
 
378 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.86 
 
 
375 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.26 
 
 
373 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  31.69 
 
 
385 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  31.42 
 
 
395 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  31.76 
 
 
377 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  32.65 
 
 
373 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.13 
 
 
369 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  32.49 
 
 
391 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.59 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  32.06 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.52 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.52 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  29.46 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.52 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.52 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.26 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.23 
 
 
369 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.65 
 
 
369 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.43 
 
 
409 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.23 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  32.15 
 
 
374 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  32.15 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  30.97 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.02 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  30.99 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.62 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  29.61 
 
 
370 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.16 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.08 
 
 
377 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.52 
 
 
396 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.65 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.7 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.76 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  32.7 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.08 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.94 
 
 
369 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.76 
 
 
400 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.54 
 
 
366 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  28.53 
 
 
367 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.39 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.34 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  32.07 
 
 
373 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.39 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.98 
 
 
389 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.34 
 
 
350 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  29.17 
 
 
368 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.79 
 
 
381 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30 
 
 
350 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.66 
 
 
353 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30 
 
 
350 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.34 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.66 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30 
 
 
350 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  33.94 
 
 
356 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  28.53 
 
 
367 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.08 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.97 
 
 
350 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.97 
 
 
350 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.29 
 
 
372 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.88 
 
 
355 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.34 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.76 
 
 
362 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.61 
 
 
365 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.1 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.35 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.42 
 
 
370 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  33.55 
 
 
380 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
370 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.7 
 
 
389 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.74 
 
 
373 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.45 
 
 
393 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>