More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1442 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
365 aa  758    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.88 
 
 
366 aa  351  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  43.51 
 
 
368 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.32 
 
 
355 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.75 
 
 
353 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.75 
 
 
353 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.5 
 
 
350 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.78 
 
 
350 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.6 
 
 
350 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.78 
 
 
350 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.5 
 
 
350 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.54 
 
 
356 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.5 
 
 
350 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.5 
 
 
350 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.07 
 
 
350 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  36.06 
 
 
367 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.7 
 
 
369 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  34.93 
 
 
367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.15 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.43 
 
 
369 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.43 
 
 
369 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.15 
 
 
369 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.14 
 
 
346 aa  199  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.87 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.36 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.21 
 
 
347 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.08 
 
 
364 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  34.68 
 
 
356 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  35.71 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.3 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.01 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.79 
 
 
367 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.69 
 
 
343 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.13 
 
 
345 aa  156  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.74 
 
 
345 aa  156  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 
367 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.84 
 
 
360 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.58 
 
 
345 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32 
 
 
341 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  35.69 
 
 
328 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.86 
 
 
372 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.81 
 
 
368 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.13 
 
 
367 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 
367 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 
367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.41 
 
 
366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.67 
 
 
370 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.86 
 
 
362 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.79 
 
 
375 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  32.1 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
390 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.1 
 
 
350 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.78 
 
 
367 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.34 
 
 
368 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.54 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.96 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.96 
 
 
369 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.62 
 
 
350 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.62 
 
 
350 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.12 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.79 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.62 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.9 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  28.12 
 
 
391 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.81 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.23 
 
 
367 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.27 
 
 
396 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.62 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  28.8 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.26 
 
 
350 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.17 
 
 
370 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.02 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.88 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
367 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  29.61 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  27.75 
 
 
387 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.94 
 
 
374 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.51 
 
 
326 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.5 
 
 
395 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28.18 
 
 
396 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  29.83 
 
 
377 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.49 
 
 
385 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.45 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  29.82 
 
 
381 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  26.27 
 
 
400 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000679  muconate cycloisomerase  32.84 
 
 
330 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.72 
 
 
391 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.14 
 
 
385 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  27.99 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.35 
 
 
382 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>