More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1639 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
342 aa  696    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  71.47 
 
 
343 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.67 
 
 
345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.37 
 
 
345 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.41 
 
 
343 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.65 
 
 
371 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.51 
 
 
356 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.57 
 
 
346 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.52 
 
 
362 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.57 
 
 
360 aa  205  9e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.42 
 
 
356 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
356 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.75 
 
 
372 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.27 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.22 
 
 
350 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.52 
 
 
350 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.52 
 
 
350 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  35.52 
 
 
356 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.52 
 
 
350 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.52 
 
 
350 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.95 
 
 
353 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.65 
 
 
350 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.57 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.52 
 
 
350 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.56 
 
 
347 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.65 
 
 
353 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.22 
 
 
350 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.61 
 
 
368 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  30.79 
 
 
367 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  32.27 
 
 
367 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.61 
 
 
368 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.67 
 
 
364 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.7 
 
 
355 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  30.36 
 
 
376 aa  156  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.19 
 
 
341 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  29.88 
 
 
380 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.99 
 
 
368 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.41 
 
 
369 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.18 
 
 
367 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.73 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.41 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.41 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.09 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.41 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.09 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.3 
 
 
367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.36 
 
 
355 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.77 
 
 
369 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.77 
 
 
369 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.37 
 
 
345 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
365 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.21 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.98 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.51 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 
350 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 
350 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  30.59 
 
 
362 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.08 
 
 
350 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 
350 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  32.37 
 
 
371 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
358 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.86 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  31.56 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.09 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.02 
 
 
395 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  29.36 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.24 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.55 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.56 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.04 
 
 
342 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
345 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.89 
 
 
367 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.53 
 
 
400 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  27.22 
 
 
400 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  23.66 
 
 
362 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.62 
 
 
342 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.38 
 
 
409 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.66 
 
 
341 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 
338 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2556  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.91 
 
 
333 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0851  hypothetical protein  26.84 
 
 
370 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.584422  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  24.76 
 
 
369 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.46 
 
 
373 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.32 
 
 
345 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  27.96 
 
 
377 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1128  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.75 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391026  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.01 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.05 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  24.44 
 
 
369 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.01 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.89 
 
 
336 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.58 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.23 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1177  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  30.19 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0928743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.08 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1018  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.7 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0985  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.38 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>