More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1114 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
356 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.46 
 
 
362 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.49 
 
 
371 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.52 
 
 
368 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.16 
 
 
372 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.23 
 
 
343 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
342 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.35 
 
 
345 aa  195  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.35 
 
 
345 aa  195  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.63 
 
 
343 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.66 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.75 
 
 
360 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.1 
 
 
368 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.99 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.36 
 
 
355 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.89 
 
 
350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.09 
 
 
350 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.89 
 
 
350 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.05 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.94 
 
 
353 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  30.59 
 
 
367 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.89 
 
 
350 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  30.59 
 
 
367 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.31 
 
 
350 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.64 
 
 
353 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.31 
 
 
350 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.89 
 
 
350 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.6 
 
 
350 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.64 
 
 
347 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  35.28 
 
 
380 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.54 
 
 
367 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.69 
 
 
376 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  32.18 
 
 
356 aa  142  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  28.65 
 
 
368 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
365 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.1 
 
 
364 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.62 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.77 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.01 
 
 
341 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.24 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.11 
 
 
355 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.63 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.24 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  32.58 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.63 
 
 
369 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.07 
 
 
369 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.77 
 
 
350 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 
350 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.43 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.43 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.43 
 
 
367 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.86 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.99 
 
 
350 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.35 
 
 
360 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3258  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.96 
 
 
355 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.915646  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 
370 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.53 
 
 
345 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
357 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.07 
 
 
358 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.75 
 
 
340 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.39 
 
 
367 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  23.96 
 
 
362 aa  100  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.89 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.9 
 
 
373 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.81 
 
 
375 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  28.66 
 
 
373 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.04 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.12 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.9 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.9 
 
 
373 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.83 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.43 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  29.57 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2150  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.43 
 
 
321 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  30.16 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.73 
 
 
354 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.34 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.14 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  30.49 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  29.73 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.56 
 
 
342 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  30.16 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  28.9 
 
 
373 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 
340 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  30.11 
 
 
344 aa  93.6  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.03 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.52 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.85 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>