More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1409 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  99.46 
 
 		 367 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 367 aa  736    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  99.46 
 
 		 367 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  83.65 
 
 		 367 aa  614  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  79.56 
 
 		 370 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.32 
 
 		 367 aa  564  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  71.86 
 
 		 367 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.56 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  39.29 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.12 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.78 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.7 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.97 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.59 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.16 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.32 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.7 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  31.62 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  32.07 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  32.88 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.02 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  32.25 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.73 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  31.54 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.61 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.28 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  32.25 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  32.25 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.92 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.71 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.73 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.93 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.56 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.66 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.26 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  31.9 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  30.46 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.15 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  33.78 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.46 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.28 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.92 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  31.44 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.7 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  31.44 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.52 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.89 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.61 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.61 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.66 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.81 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.28 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.84 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.08 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.03 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  30.52 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.03 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.38 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  26.37 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.03 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.71 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.71 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.71 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  26.28 
 
 		 367 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.98 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.71 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.7 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.23 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  28.33 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  26.98 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  27.45 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.73 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.71 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  31.33 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.9 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2539  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.98 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>