More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0393 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  100 
 
 
369 aa  745    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  63.76 
 
 
372 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.28 
 
 
370 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.83 
 
 
377 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.58 
 
 
375 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.31 
 
 
369 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.52 
 
 
371 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  43.9 
 
 
369 aa  329  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  46.78 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.15 
 
 
368 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.02 
 
 
370 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.32 
 
 
370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.43 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.79 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.81 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.5 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  47.43 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.17 
 
 
370 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.88 
 
 
368 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  40.06 
 
 
368 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  40.06 
 
 
368 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  40.06 
 
 
368 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  39.78 
 
 
368 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  39.78 
 
 
368 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  46.31 
 
 
366 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  41.74 
 
 
368 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  39.5 
 
 
368 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  38.95 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  38.95 
 
 
368 aa  288  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.3 
 
 
369 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.45 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  47.86 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.29 
 
 
370 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.72 
 
 
380 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  47.71 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.16 
 
 
370 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.25 
 
 
372 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.69 
 
 
377 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.4 
 
 
391 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  35.42 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.24 
 
 
378 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  29.09 
 
 
370 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.39 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.7 
 
 
385 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  30.18 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
955 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.15 
 
 
351 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  38.98 
 
 
334 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.97 
 
 
377 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  28.54 
 
 
1027 aa  149  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
367 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.28 
 
 
367 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
367 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.75 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.25 
 
 
386 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
367 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  30.68 
 
 
374 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.51 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  32.38 
 
 
391 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  30.49 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  30.49 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.67 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.32 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.66 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.66 
 
 
369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.94 
 
 
370 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.4 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.75 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.75 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.87 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.4 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.79 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.67 
 
 
369 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.48 
 
 
369 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  27.81 
 
 
376 aa  110  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.41 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.07 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.75 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.4 
 
 
369 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.78 
 
 
353 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.77 
 
 
393 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.52 
 
 
372 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.06 
 
 
391 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.95 
 
 
372 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 
350 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.32 
 
 
364 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.3 
 
 
375 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.03 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.08 
 
 
365 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.17 
 
 
350 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.16 
 
 
350 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.08 
 
 
350 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.18 
 
 
377 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 
356 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.39 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.03 
 
 
385 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.62 
 
 
390 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.67 
 
 
378 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.93 
 
 
356 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>